Как автоматически преобразовать текстовый файл в точечный файл graphviz?

Я пытаюсь автоматически преобразовать свой текстовый файл в неориентированный граф с помощью graphviz. Текстовый файл состоит из следующего кода:

0

A
Relation
B
A
Relation
C
B
Relation
C
1

0

A
Relation
C

B
Relation
C
1

Здесь A, B и C — узлы. Мне может потребоваться один или несколько графиков. 0 и 1 представляют начало и конец каждого графика. Количество связей также может варьироваться. Я попытался продолжить с sed, но заблудился. Как мне поступить, чтобы получить требуемый график? Спасибо за вашу помощь.


graph pygraphviz graphviz text-manipulation
person abhisekG    schedule 12.01.2014    source источник
comment
Не могли бы вы привести пример того, как, по вашему мнению, должны выглядеть полученные графики? Правильно ли я думаю, что второй будет выглядеть примерно как A -- C -- B, а первый будет треугольником с A, B и C в трех углах.   -  person Simon    schedule 13.01.2014
comment
Да, точно. Первый будет содержать A, B и C в трех углах. Второй будет содержать A--C--B, т. е. C связан с B и с обоими.   -  person abhisekG    schedule 13.01.2014

Ответы (2)


arrow_upward
3
arrow_downward

Я сам не использую PyGraphViz, но обработка текста в Python достаточно проста. Учитывая входной файл в вопросе, который я назвал gra1.txt, и файл Python gr.py следующим образом:

import sys, subprocess

count = 0
for line in sys.stdin:
    if line[0] == '0':
        outf = "g%d" % (count)
        g = "graph G%d {\n" % (count)
        count += 1
    elif line[0] == '1':
        g += "}\n"
        dot = subprocess.Popen(["dot", "-Tjpg", "-o%s.jpg" % outf], 
                stdin=subprocess.PIPE,universal_newlines=True)
        print (g)
        dot.communicate(g)  
    elif len(line.rstrip()) == 0:
        pass
    else:
        first = line.rstrip()
        rel = sys.stdin.readline()
        last = sys.stdin.readline().rstrip()
        g += "%s -- %s\n" % (first,last)

... команда python gra1.py <gra1.txt выводит:

$ python gra1.py <gra1.txt
graph G0 {
A -- B
A -- C
B -- C
}

graph G1 {
A -- C
B -- C
}

... вместе с файлами g0.jpg:

введите здесь описание изображения

... и g1.jpg:

введите здесь описание изображения

person Simon    schedule 13.01.2014

arrow_upward
1
arrow_downward

Вы можете сделать это с помощью библиотеки Python graphviz. Для его установки нужно просто запустить:

pip install graphviz

а затем в Python вы можете сделать:

from graphviz import Source

text_from_file = str()
with open('graphviz_dot_file.txt') as file:
    text_from_file = file.read()

src = Source(text_from_file)
src.render(test.gv', view=True )

Дополнительную информацию можно найти в руководстве по Graphviz.

person RousseauAlexandre    schedule 29.06.2016
comment
Я получил ошибку при попытке вашего решения, PUN-U531305L001:Desktop 531305$ python graph.py Traceback (последний последний вызов): файл graph.py, строка 8, в ‹module› src.render('test.gv', view=True) Файл /Library/Python/2.7/site-packages/graphviz/files.py, строка 226, в рендеринге «находятся в вашей системе» путь «% cmd) RuntimeError: не удалось выполнить ['точка', ' -Tpdf', '-O', 'test.gv'], убедитесь, что исполняемые файлы Graphviz находятся на пути вашей системы - person Bhupesh Pant; 25.07.2016
comment
У меня была аналогичная проблема. Похоже, вы используете Graphviz на Widows. Убедитесь, что у вас есть Graphviz в ваших системных переменных пути. Здесь ваше решение - person RousseauAlexandre; 25.07.2016