Я хочу создать лактамный мостик (пептидную связь) между двумя остатками через их боковые цепи, начиная с исходной пептидной последовательности (файл pdb). Я использовал две функции из PYMOL «связь» и «предохранитель», чтобы сформировать эту связь. «Связь» работает нормально, но связь больше не существует, когда я снова открываю файл (это то, что я имею в виду под «стабильным»). «Предохранитель» вообще не показывает эту связь.
Выберите остатки PYMOL> связь pk1, pk2 или PYMOL> предохранитель pk1, pk2
Какие-либо предложения?
