Я пытаюсь установить samtools () на cygwin. Я выполнил различные уловки здесь и здесь, но похоже, что моя проблема в том, что я не могу работать pthread. gcc установлен и работает, zlib установлен и работает, а ncurses установлен и работает + все было добавлено в $ PATH ... но когда я запускаю make, он попадает в следующую строку в Makefile:
gcc -pthread $(LDFLAGS) -o $@ $(AOBJS) libbam.a $(HTSLIB) $(LDLIBS) $(LIBCURSES) -lm -lz
тогда он выдает ошибку, потому что не распознает команду unix -pthread. теперь ... pthread должен быть частью установки по умолчанию в cygwin, поэтому я не понимаю, почему это не работает ...
любая подсказка была бы замечательной!
