Исполняемые файлы Graphviz не найдены (Python 3.4)

У меня также была эта проблема на Ubuntu 16.04.

Исправлено запуском sudo apt-get install graphviz в дополнение к установке pip, которую я уже выполнил.

В моем случае (ноутбук Win10, Anaconda3, Jupyter) после "conda install graphviz" я должен добавить в PATH: C:\Users\username\Anaconda3\Library\bin\graphviz

Чтобы изменить PATH, перейдите к Control Panel > System and Security > System > Advanced System Settings > Environment Variables > Path > Edit > New

Поскольку Mac OS не упоминалась, я добавлю, что у меня была такая же проблема в OS X Yosemite, решение, которое я нашел, состояло в том, чтобы сделать brew install graphviz

Это решило проблему, не уверен, что мне не стоило просто редактировать один из других ответов в этом списке, потому что все они кажутся одним и тем же ответом, просто установите официальный пакет в дополнение к библиотеке Python.

На ноутбуке jupyter (ipython) с anaconda в win10 я решил проблему conda install graphviz после того, как установил graphviz pip install graphviz

Я решил установить его непосредственно из https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html и включить в путь Windows:

C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin

C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38

После перезапуска виндовс

когда вы добавляете C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin в PATH, вы должны закрыть свою среду IDE, такую ​​​​как spyder, и перезапустить, вы решите «RuntimeError: убедитесь, что исполняемые файлы Graphviz находятся в ваших системах. ' дорожка"

Чтобы решить эту проблему, после успешной установки graphviz2.38 добавьте переменную PATH в системный путь. В разделе «Системные переменные» вы можете щелкнуть «Путь», затем нажать «Изменить» и добавить; C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\ bin в конец строки и сохранен. После этого перезапустите pythonIDE, как шпион, и все заработает.

Не забудьте закрыть Spyder, а затем перезапустить.

Если вы используете Win10, установите Graphviz, а затем используйте следующую команду, чтобы добавить путь.

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38/bin/'

Обратите внимание, что я использую Windows 10. Некоторое из следующего может быть применимо или не применимо к другим версиям Windows или операционных систем:

** Примечание 2: **
"адрес bin-файла Graphviz на ваша система» может быть C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin или любой другой путь, по которому вы установили Graphviz туда.

У нас проблема не только с Graphviz, но и с другими внешними EXE-файлами, которые мы хотим использовать в Jupyter.
Причина в том, что когда jupyter хочет импортировать пакет, он ищет его в рабочем каталоге, а когда ему не удается найти пакет, он возвращает такие ошибки.
Что мы можем решить эту проблему следующим образом:
1) проверьте, установлен ли Graphviz в вашей системе, и если нет, вы можете загрузить и установить его с:

https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html
а затем установите его. Когда вы устанавливаете Graphviz, имейте в виду, куда (в какую папку) вы его устанавливаете. Если вы видите указанную выше ошибку при использовании

import graphviz

тогда у вас есть несколько вариантов:

2) вы можете вызвать файл .exe в ipynb через

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + r'the Graphviz bin file address on your system'

По моему опыту, это работает только для того же ipynb, с которым я работаю, и каждый раз, когда я открываю блокнот, мне нужно вызывать эти строки кода.

3) Если вы хотите, чтобы Jupyter нашел исполняемый файл, вам нужно указать путь к среде.
В Windows 10 вы можете сделать это, выбрав:
Панель управления > Система и безопасность > Система > Дополнительные параметры системы > Переменные среды > Путь > Изменить > Создать
, а затем добавить «адрес bin-файла Graphviz в вашей системе». В Windows 8 или более ранней версии перейдите в:
Панель управления > Система и безопасность > Система > Расширенные системные настройки > Переменные среды
, а затем добавьте ;(точка с запятой) + "адрес bin-файла Graphviz в вашей системе" в конец строки пути
Примечание: не забудьте перезагрузить компьютер.

4) и даже это не работает, определите переменную, выбрав:
Панель управления > Система и безопасность > Система > Дополнительные параметры системы > Переменные среды, а затем:

Затем определите следующую переменную:

Не забудьте назвать переменную Graphviz. Наконец, перезагрузите компьютер и надейтесь, что это сработает.

Я столкнулся с той же проблемой в Jupyter Notebook. Добавьте это, и все готово.

import os

os.environ['PATH'] = os.environ['PATH']+';'+os.environ['CONDA_PREFIX']+r"\Library\bin\graphviz"

Просто установите

conda install graphviz

затем установите

conda install -c conda-forge pydotplus

Для Windows 8.1 и Python 2.7 я исправил проблему, выполнив следующие шаги.

1 . Загрузите и установите graphviz-2.38.msi http://www.graphviz.org/pub/graphviz/stable/windows/graphviz-2.38.msi

2 . Установите переменную пути

• Панель управления> Система и безопасность> Система> Дополнительные параметры системы> Переменные среды> Путь> Изменить
• добавить 'C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin'

Судя по всему, у Graphviz2.37 есть проблемы с переменной PATH в Windows. Я удалил его, удалил связанные с ним переменные среды и вместо этого загрузил и установил более новую бета-версию 2.39, и теперь она работает как шарм.

Я попытался настроить переменную среды. Не сработало. Я нахожусь в среде Windows. У меня сработало сочетание вышеперечисленных методов:

1. Загруженный graphviz-2.38.zip из https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html

2. Скопировал извлеченную папку в C:\Users\\AppData\Local\Continuum\anaconda3\pkgs\Graphviz2.38

3. Я назвал местоположение Graphviz в своем коде

   Построить классификатор

   import sklearn.datasets as datasets
   import pandas as pd
   from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
   iris=datasets.load_iris()
   df=pd.DataFrame(iris.data, columns=iris.feature_names)
   y=iris.target
   
   dtree=DecisionTreeClassifier()
   dtree.fit(df,y)
   

   Построить дерево

   from sklearn.externals.six import StringIO  
   from IPython.display import Image  
   from sklearn.tree import export_graphviz
   import pydotplus
   import graphviz
   import os
   os.environ\["PATH"\] += os.pathsep + 'C:/Users/tstusr/AppData/Local/Continuum/anaconda3/pkgs/Graphviz2.38/bin'
   
   dot_data = StringIO()
   export_graphviz(dtree, out_file=dot_data,  
                   filled=True, rounded=True,
                   special_characters=True)
   graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())  
   Image(graph.create_png())
   

   Вот как выглядит дерево:

Я использую Windows 10, Python 3.6 на Anaconda 3 и столкнулся с той же проблемой.

У меня это сработало, выполнив последовательно следующие действия:

1. Из терминала Anaconda: pip install pydotplus
2. Из терминала Anaconda: conda install pydotplus
3. Из терминала Anaconda: pip install graphviz
4. Из терминала Anaconda: conda install graphviz
5. Пошел в среду Windows Varialbes, PATH и добавил расположение моего файла dot.exe в каталоге graphviz в Anaconda.

работал нормально после этого.

Я столкнулся с той же проблемой, пытаясь создать дерево решений с помощью pydotplus и graphviz. И использовал метод переменной пути для решения этой проблемы.

Ниже приведены точные шаги, которые я использовал:

1. Хотя у меня уже был графвиз через команду установки conda, я повторно загрузил последний пакет по указанному ниже пути. https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html Загружено: graphviz-2.38.zip (стабильная версия)

2. Скопировал извлеченную папку по следующему пути на диск C:. C:\Program Files (x86)\

3. Изменена системная переменная пути и добавлен следующий путь к ней. Переменная пути: Панель управления > Система и безопасность > Система > Расширенные настройки системы > Переменная среды > Путь C:\Program Files (x86)\graphviz-2.38\release\bin;

4. После добавления вышеуказанного пути к переменной среды перезапустите систему.

5. Это сработало нормально, и я смог создать дерево решений в png.

   введите здесь описание изображения

У меня была такая же проблема с Windows 10.

Сначала я без проблем установил graphviz-2.38.0 с помощью следующей команды...

install -c anaconda graphviz=2.38.0

Во-вторых, я без проблем установил pydotplus с помощью следующей команды...

install -c conda-forge pydotplus

После этого, когда я добрался до своего шага, чтобы визуализировать мое дерево решений, возникла следующая проблема с {InvocationException: GraphViz's executables not found}...

C:\Users\admin\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in create(self, prog, format)
   1958             if self.progs is None:
   1959                 raise InvocationException(
-> 1960                     'GraphViz\'s executables not found')
   1961 
   1962         if prog not in self.progs:

InvocationException: GraphViz's executables not found

В моем случае все, что мне нужно было сделать, чтобы исправить это, — это поместить путь к исполняемым файлам graphviz в мою пользовательскую переменную среды PATH, и это исправило ее. Просто убедитесь, что это путь, по которому находятся YOUR.exe файлов :)

C:\Users\admin\Anaconda3\pkgs\graphviz-2.38.0-4\Library\bin\graphviz

Пробовал много способов, и вот что действительно решило проблему - это работало как для Windows 8.1/10, так и для Python 3.

1 . pip установить графвиз

2 . необходимо выполнить ключевое действие, чтобы установить переменную пути, выполнив следующие шаги:

а. Панель управления > Система и безопасность > Система > Дополнительные параметры системы > Переменные среды > Путь > Изменить b. добавить 'C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin'

Пытаться

import os

os.environ['PATH']=os.environ['PATH']+';'+os.environ['CONDA_PREFIX']+r"\Library\bin\graphviz"

У меня была такая же проблема в Ubuntu (14.04) с Jupyter.

Чтобы решить эту проблему, я добавил точечную библиотеку в python sys.path.

Первое: проверьте, установлена ​​ли точка,

Затем: найти его путь whereis dot -> /local/notebook/miniconda2/envs/ik2/bin/dot

Наконец, в скрипте Python: sys.path.append("/local/notebook/miniconda2/envs/ik2/bin/dot")

Пожалуйста, используйте pydotplus вместо pydot

1. Найти:C:\Users\zhangqianyuan\AppData\Local\Programs\Python\Python36\Lib\site-packages\pydotplus

2. Открыть graphviz.py

3. Найдите строку 1925 - строку 1972, найдите функцию:

   def create(self, prog=None, format='ps'):
   

4. В функции найти:

   if prog not in self.progs:
       raise InvocationException(
           'GraphViz\'s executable "%s" not found' % prog)
   
   if not os.path.exists(self.progs[prog]) or \
           not os.path.isfile(self.progs[prog]):
       raise InvocationException(
           'GraphViz\'s executable "{}" is not'
           ' a file or doesn\'t exist'.format(self.progs[prog])
       )
   

5. Между двумя блоками добавьте это (путь к исполняемому файлу Graphviz):

     self.progs[prog] = "C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/gvedit.exe"`
   

6. После добавления результат:

   if prog not in self.progs:
       raise InvocationException(
           'GraphViz\'s executable "%s" not found' % prog)
   
   self.progs[prog] = "C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/gvedit.exe"
   
   if not os.path.exists(self.progs[prog]) or \
           not os.path.isfile(self.progs[prog]):
       raise InvocationException(
           'GraphViz\'s executable "{}" is not'
           ' a file or doesn\'t exist'.format(self.progs[prog])
       )
   

7. сохраните измененный файл, после чего вы сможете успешно запустить его.

8. вам лучше сохранить его как файл bmp, потому что файл png не будет работать.

Я не уверен, что это ответ на ЭТОТ вопрос, но это также похоже на вопрос «как мне заставить graphviz работать на моей установке?» нить. Я также нигде не видел упоминания python-graphviz.

Таким образом: Ubuntu 16.04, conda Python 3.7, с использованием ноутбуков Jupyter.

conda install -c anaconda graphviz
conda install -c conda-forge python-graphviz

Изображения не отображались после попытки только первой команды; они сделали рендеринг после запуска второго.

Я также установил pydot-plus, но не заметил никаких изменений в поведении, производительности или разрешении изображения.

Я очень долго застрял на этой проблеме, но через какое-то время я нашел решение:

• pip установить графвиз
• conda установить графвиз
• Теперь снова установите graphviz из =› https://graphviz.org/_pages/Download/Download_windows.html (файл MSI)
• После завершения установки задайте путь => C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin;

Для всех тех, кто столкнулся с этой проблемой в Windows 10, даже после выполнения вышеупомянутых шагов, это сработало для меня. Для пользователей Windows 10, пытающихся отладить эту же ошибку, запустите CMD от имени администратора (важно!) и запустите dot -c, а затем запустите dot -v
Это решило проблему для меня

Самое простое решение, которое сработало для меня (Windows 10, Jupyter Notebook) для этой проблемы, — это сделать следующее:

1. pip установить графвиз
2. перезапустить юпитер
3. Поместите следующий код в блокнот и выполните:

import sys

sys.path.append('C:/Users/usrname/AppData/Local/Continuum/anaconda3/Library/bin/graphviz/')

Это свежее решение, которое я использовал :)

У меня такая же проблема, я использую Anaconda и Jupyter Notebook.

То, что я сделал, чтобы решить эту проблему, НЕ устанавливал Graphiz.zip из Интернета!

Я только что сделал следующие шаги:

1. Создайте новую среду с помощью ››conda create -n [env_name]
2. установите библиотеку graphviz внутри этой новой среды: ›› conda install graphviz
3. Я записал эти строки в ячейку блокнота и запустил import os os.environ['PATH'] = os.environ['PATH']+';'+os.environ['CONDA_PREFIX']+r"\Library\bin\graphviz"

Наконец-то изображение появилось, для этого я сделал небольшую вечеринку, потому что у меня это заняло 3 дня :(

Для меня (Windows 10 + Pycharm2020) это сработало:

• Добавлено C:\Program Files\Graphviz\bin в PATH (путь к двоичным файлам Graphviz)
• Перезагрузка. Возможно, перезапуска PyCharm будет достаточно.

Я только что встретил ту же проблему. И вот мои решения.

1.) установить графвиз

убедитесь, что вы можете найти эту папку INSTALL_LOCATION\Graphviz2.38\bin

2.) Для объекта Dot добавьте этот код

dot.set_graphviz_executables( {'dot': r'C:\Program Files\Graphviz\bin\dot.exe'})

В graphviz.py эта функция позволяет вручную указать путь к исполняемому файлу. Затем вы сможете запустить код.

К вашему сведению: вот описание из set_graphviz_executables

    This method allows to manually specify the location of the GraphViz
    executables.

    The argument to this method should be a dictionary where the keys are
    as follows:

        {'dot': '', 'twopi': '', 'neato': '', 'circo': '', 'fdp': ''}

    and the values are the paths to the corresponding executable,
    including the name of the executable itself.

Полные шаги по настройке Graphviz для Anaconda — Jupiternotebook:

Загрузите и установите «EXE-установщик для Windows 10» со страницы: https://graphviz.org/download/.

Переменная среды: добавьте C:\Program Files\Graphviz 2.44.1\bin в путь пользователя.

Переменная среды: добавьте C:\Program Files\Graphviz 2.44.1\bin\dot.exe в системный путь.

Проверьте эти шаги после установки graphviz:

1. pip установить графвиз.
2. pip установить pydotplus
3. конда установить pydotplus
4. Добавьте путь к переменным окружения (C:\Users‹username›\anaconda3\Library\bin\graphviz)
5. Перезапустите ядро ​​ноутбука Anaconda Jupiter (если оно уже запущено).

Я решил эту проблему, сначала удалив все установленные версии pydot, pydotplus и graphvis с помощью

pip uninstall pydot 
pip uninstall pydotplus
pip uninstall graphviz

Затем я переустановил их с помощью:

conda install graphviz
conda install pydot
conda install pydotplus