Разделение lib_main было определено несколько раз
В "com.android.tools.build:gradle:2.0.0-alpha3" сборка прошла успешно, но ошибки, возникающие в "com.android.tools.build:gradle:2.0.0-alpha5".
наконец-то мгновенная работа !! com.android.tools.build:gradle:2.0.0-alpha8 и gradle.properties "org.gradle.jvmargs = -Xmx8g" было решено изменить.
Для тех, кому интересно, что такое InstantRun (первая настройка на картинке): 
И да, отключение этого параметра решает проблему.
Изменить 19.01.16
com.android.tools.build:gradle:2.0.0-alpha6 был выпущен три дня назад. При использовании этой новой версии ошибка «Split lib_main была определена несколько раз» исчезла, и установка приложения прошла успешно, но теперь я получаю сообщение об ошибке выполнения:
java.lang.RuntimeException: Unable to instantiate application
com.android.tools.fd.runtime.BootstrapApplication:
java.lang.ClassNotFoundException: Didn't find class
"com.android.tools.fd.runtime.BootstrapApplication" on path:
DexPathList[[zip file "/data/app/com.onegravity.k10.pro2-2/base.apk",
zip file "/data/app/com.onegravity.k10.pro2-/split_lib_main.apk"]
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: Didn't find class
"com.android.tools.fd.runtime.BootstrapApplication" on path:
DexPathList[[zip file "/data/app/com.onegravity.k10.pro2-2/base.apk",
zip file "/data/app/com.onegravity.k10.pro2-2/split_lib_main.apk"]
Suppressed: java.io.IOException: No original dex files found for dex location
/data/app/com.onegravity.k10.pro2-2/base.apk
Suppressed: java.lang.ClassNotFoundException:
com.android.tools.fd.runtime.BootstrapApplication
Отключение мгновенного запуска устраняет эту ошибку. Подождем com.android.tools.build:gradle:2.0.0-alpha7 ...
Изменить 25.01.16
com.android.tools.build:gradle:2.0.0-alpha7 был выпущен два дня назад.
Получение того же исключения, что и с 2.0.0-alpha6
Просто удалите build папку из appmodule и перестройте проект!
Это решит проблему !.
Я столкнулся с этой проблемой после рефакторинга и изменения имени приложения в gradle. Следуя примеру AskQ, я перестроил проект (немного по другому пути):
Build-> Clean Project
с последующим
Build-> Rebuild Project
Решил проблему
Восстановление:
Удаление папки (projectFolder) / app / build и повторная сборка сработали для меня. (как ответил @AskQ)
Интересно, сработало бы также Сборка> Чистый проект; из меню графического интерфейса Android Studio.
Избегание:
В моем случае проблема, похоже, возникла из-за того, что я скопировал и вставил проект, поэтому у двух проектов было одинаковое имя.
Есть и другие причины, изучение того, что они собой представляют, может помочь пользователям избежать этой проблемы.
Это может произойти из-за того, что имя вашего пакета написано в верхнем регистре, поэтому вы должны изменить его обратно на нижний регистр.
Android studio 2.3.3 У меня сработало после отключения мгновенного запуска в настройках ...
Выберите Настройки -> Сборка, выполнение и разработка -> Мгновенный запуск -> снимите флажок Включить мгновенный запуск для горячей замены затем очистите проект и заново соберите свой проект !!
