Открытие файлов .im (данные nanoSIMS) на FIJI с помощью макроса

Я ищу команду макроса для открытия файлов .im в FIJI.

Поскольку FIJI не поддерживает формат .im, для него требуется плагин под названием OpenMIMS, а простые строки:

run("Open MIMS Image"); 
open(" directory ");

выдаст сообщение об ошибке:

Файл имеет неподдерживаемый формат, плагин для чтения недоступен или не найден.

Почти тот же вопрос, по-видимому, был задан и решен здесь - Проблемы с плагином ImageJ, за исключением того, что я уже использую FIJI, и Bio-Formats не будет решением моей проблемы, поскольку он также не поддерживает файлы .im.

Я был бы очень признателен, если бы кто-нибудь просветил меня. знак равно


plugins macros imagej
person user6032582    schedule 08.03.2016    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
2
arrow_downward

Сначала следует проверить, можете ли вы открыть файл с помощью меню через Плагины > Открыть изображение MIMS. (Я предполагаю, что вы установили плагин OpenMIMS в соответствии с этими инструкциями, добавив сайт обновления .)

Если вы сделаете это во время работы устройства записи макросов, оно должно записать необходимую команду для использования в коде макроса. .

В строках, которые вы разместили, вторая строка:

open(" directory ");

не имеет никакого смысла и само по себе приведет к опубликованному вами сообщению об ошибке (посмотрите на вторую часть сообщения об ошибке, чтобы узнать путь, который ImageJ пытается открыть).

person Jan Eglinger    schedule 08.03.2016