Linux C/C++ выделяет/освобождает память в динамической библиотеке

Я бы настоятельно рекомендовал, чтобы модуль, который выполняет выделение, также отвечал за освобождение. Таким образом:

int *ptr = module1->getIntData();
...
module1->freeIntData(ptr);

Это позволяет различным модулям без труда использовать разные распределители (malloc/free, new/delete, slab allocator и т. д.).

В системах Posix в процессе может быть только одна реализация malloc (и free), поэтому, если определение getIntData "возвращает указатель, который должен быть освобожден free", тогда все будет в порядке. С другой стороны, я думаю, что можно было бы написать два компилятора C++, которые можно было бы использовать для написания модуля1 и модуля2, но которые не могли delete памяти выделять другим new. (Хотя я думаю, что такие компиляторы в настоящее время не существуют).

Если есть малейший проблеск шанса, что вам когда-либо придется портировать эту партию на Windows, тогда вы действительно хотите, чтобы модули освобождали выделенную ими память. Различные библиотеки DLL могут иметь разные кучи, что может привести к всевозможным забавным проблемам. (Как говорит @trojanfoe в комментариях: одной лишь разницы между сборками отладки и выпуска может быть достаточно, чтобы вызвать горе.)

Я бы рекомендовал использовать std::unique_ptr только в том случае, если вы можете гарантировать, что все модули всегда будут собираться с использованием одной и той же версии одного и того же компилятора с использованием одинаковых флагов компилятора. (Я твердо верю в то, что интерфейсы динамических библиотек должны быть как можно более простыми и похожими на C.)