Как преобразовать сеть в белковую форму в цитоскейпе?

У меня есть белковая сеть, загруженная в цитоскейп. Я хочу, чтобы узлы сети имели форму, соответствующую форме/структуре белка. Это делается для того, чтобы я мог наложить изображение сети на изображение структуры белка. Я пробовал RINanalyzer и Structureviz2, но это не помогло. Любые решения?


cytoscape protein-database
person Adeetya    schedule 10.04.2017    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
1
arrow_downward

Можете ли вы уточнить, что не работает с RINalyzer и StructureViz2? Макет, предоставляемый RINalyzer, обычно меня вполне устраивает.

-- скутер

person Scooter Morris    schedule 13.04.2017
comment
Я хочу, чтобы узлы в сети находились в положении соответствующих остатков в белке - person Adeetya; 15.05.2017
comment
В последней версии RINalyzer появился новый макет (RINlayout). Запустите этот макет после того, как вы создали RIN, и он должен переместить остатки примерно в нужное место. - person Scooter Morris; 25.05.2017