Как CLLocation реализует протокол Equatable?

Просто полностью проверьте, что JAL сказал в своем ответе, я написал:

import Foundation
import UIKit
import CoreLocation

class ViewController: UIViewController{

    var cl1 = CLLocation()
    var cl2 = CLLocation()

    override func viewDidLoad() {
        super.viewDidLoad()
        if cl1 == cl2{

        }
    }
}

Затем я по команде нажал на == (из if cl1 == cl2). Мне потребовалось:

extension NSObject : CVarArg {
}

public func ==(lhs: Selector, rhs: Selector) -> Bool

public func ==(lhs: NSObject, rhs: NSObject) -> Bool

public struct NSZone {
}

Чтобы перепроверить, я нажал на CLLocation и увидел:

open class CLLocation : NSObject, NSCopying, NSSecureCoding {
...
}

Таким образом, в основном == потому, что он является подклассом NSObject, который сравнивает только ссылки.

Как CLLocation реализует протокол Equatable?

Это не так. Нет переопределенной функции ==, которая сравнивает два экземпляра CLLocation. При вызове == с двумя экземплярами CLLocation используется функция NSObject ==:

public func ==(lhs: NSObject, rhs: NSObject) -> Bool

Чтобы фактически сравнить два экземпляра CLLocation, либо сравните свойства каждого из них (широта или долгота), либо используйте встроенный метод distance(from:) с двумя местоположениями и сравните его с порогом CLLocationDistance.

Класс CLLocation, как и любой другой класс, соответствующий Equatable, реализует оператор (==)

И чтобы ответить на другие ваши вопросы, я решил запустить игровую площадку с этим кодом.

import UIKit
import CoreLocation

var str = "Hello, playground"

var coordinate = CLLocationCoordinate2D.init(latitude: 42.0, longitude: 42.0)
var accuracy = CLLocationAccuracy.init(24.0)
var date = Date.init(timeIntervalSinceNow: 0)

var loc1 = CLLocation.init(coordinate: coordinate, altitude: 44.0, horizontalAccuracy: accuracy, verticalAccuracy: accuracy, timestamp: date)
var loc2 = CLLocation.init(coordinate: coordinate, altitude: 44.0, horizontalAccuracy: accuracy, verticalAccuracy: accuracy, timestamp: date)
var loc3 = CLLocation.init(latitude: 42.0, longitude: 42.0)
var loc4 = CLLocation.init(latitude: 42.0, longitude: 42.0)
var loc5 = CLLocation.init(coordinate: coordinate, altitude: 44.0, horizontalAccuracy: accuracy, verticalAccuracy: accuracy, course: .infinity, speed: 55.0, timestamp: date)
var loc6 = CLLocation.init(coordinate: coordinate, altitude: 44.0, horizontalAccuracy: accuracy, verticalAccuracy: accuracy, course: .infinity, speed: 55.0, timestamp: date)

var bool1 = loc1 == loc2  //false
var bool2 = loc2 == loc3  //false
var bool3 = loc2 == loc2  //true
var bool4 = loc1 == loc4  //false
var bool5 = loc5 == loc6  //false

и единственный тип bool, который возвращает TRUE, это bool3.

поэтому независимо от того, одинаковы ли отдельные свойства разных объектов CLLocation, оператор == не будет рассматривать объекты как равные. Я предполагаю, что лучший способ для сравнения местоположений - это сравнить поля объектов CLLocation, которые вас интересуют.