Проверка папки на предмет имени файла и экспорт в PDF, если он не найден

Вы неправильно используете петли. В настоящее время вы создаете больше PDF-файлов одного и того же листа, потому что, проходя через dashFiles, вы создаете PDF-файл, еще один PDF-файл для каждого существующего PDF-файла.

Измените часть кода следующим образом:

var pdfNames = {}; //Object instead of array

while (pdfFiles.hasNext()) {
   var currentFile2 = pdfFiles.next();
   var fileName2 = currentFile2.getName();
   pdfNames[fileName2] = true; // use PDF name as key for faster searching
}

while (dashFiles.hasNext()) {
  var currentFile = dashFiles.next();
  var fileName = currentFile.getName();

  if(pdfNames[fileName + ".pdf"]) { // is exists pdf?
    Logger.log("YES");
  }
  else {
    var xlsBlob = currentFile.getBlob(); // Blob source of Excel file for conversion
    var xlsFilename = currentFile.getName(); // File name to give to converted file; defaults to same as source file
    pdfFolder.createFile(currentFile.getAs(MimeType.PDF));
    Logger.log("pdf Created");
  }
}

Вы можете создать объект имен файлов со значением true, а затем проверить наличие имени файла в объекте. Если имя файла существует, продолжайте цикл.

var pdfNames = {};//Create an object - not an array
pdfNames[fileName2] = true;//Put the file name into the object
if (pdfNames[fileName]) {//Test for file name in the object

Код:

function createPdf() {
  var currentFile,fileName,xlsBlob,xlsFilename;
  var pdfFolder = DriveApp.getFolderById("ID")
  var pdfFiles = pdfFolder.getFiles();
  var dashFolder = DriveApp.getFolderById('ID');
  var dashFiles = dashFolder.getFiles();
  var pdfNames = {};
  var dashNames = [];

  while (pdfFiles.hasNext()) {
     var currentFile2 = pdfFiles.next();
     var fileName2 = currentFile2.getName();
     pdfNames[fileName2] = true;//Put the file name into the object
  }

  while (dashFiles.hasNext()) {
    currentFile = dashFiles.next();
    fileName = currentFile.getName();
    dashNames.push(fileName);

    if (pdfNames[fileName]) {//The file name was found in the object of pdf files
      Logger.log("YES");
      continue;
    }

    xlsBlob = currentFile.getBlob(); // Blob source of Excel file for conversion
    xlsFilename = currentFile.getName(); // File name to give to converted file; defaults to same as source file
    pdfFolder.createFile(currentFile.getAs(MimeType.PDF));
    Logger.log("pdf Created");
  }

}

Оригинальный ответ:

Проверить наличие имени файла в массиве pdf другим способом.

pdfNames.indexOf(fileName + ".pdf") !== -1

Если значение не найдено в массиве, indexOf() возвращает минус один. Итак, если возвращаемое значение не минус один, то имя файла найдено. Если имя файла было найдено, вам не нужно создавать новый файл, поэтому продолжайте.

function createPdf() {
  var currentFile,fileName,xlsBlob,xlsFilename;
  var pdfFolder = DriveApp.getFolderById("ID")
  var pdfFiles = pdfFolder.getFiles();
  var dashFolder = DriveApp.getFolderById('ID');
  var dashFiles = dashFolder.getFiles();
  var pdfNames = [];
  var dashNames = [];

  while (pdfFiles.hasNext()) {
     var currentFile2 = pdfFiles.next();
     var fileName2 = currentFile2.getName();
     pdfNames.push(fileName2);
  }

  while (dashFiles.hasNext()) {
    currentFile = dashFiles.next();
    fileName = currentFile.getName();
    dashNames.push(fileName);

    if (pdfNames.indexOf(fileName + ".pdf") !== -1) {//The file name was found in the array of pdf files
      Logger.log("YES");
      continue;
    }

    xlsBlob = currentFile.getBlob(); // Blob source of Excel file for conversion
    xlsFilename = currentFile.getName(); // File name to give to converted file; defaults to same as source file
    pdfFolder.createFile(currentFile.getAs(MimeType.PDF));
    Logger.log("pdf Created");
  }

}