Не удалось закрыть файлы JposLogger

Вам нужно создать экземпляр вашего регистратора и loglisteners только один раз в вашем приложении.

Один из вариантов — использовать Logger.getLogger() для регистрации и создания регистратора.

Сначала вам нужно создать регистратор только один раз в вашем приложении, например, с помощью такого метода

public void initLogger() {
    Logger logger = Logger.getLogger("Q2"); //this creates a logger and register it with Q2 name
    org.jpos.util.DailyLogListener dayLog = new org.jpos.util.DailyLogListener();
    ProtectedLogListener pll = new ProtectedLogListener();
    Configuration protectLogCfg = new SimpleConfiguration();
    protectLogCfg.put("protect", "2");
    pll.setConfiguration(protectLogCfg);
    logger.addListener(pll);

    Configuration dayLogCfg = new SimpleConfiguration();
    dayLogCfg.put("window", "86400");
    dayLogCfg.put("prefix", logLocation);
    dayLogCfg.put("suffix", ".log");  
    dayLogCfg.put("date-format", "-yyyy-MM-dd");
    dayLog.setConfiguration(dayLogCfg);   
    logger.addListener(dayLog);
    logger.addListener(new SimpleLogListener(System.out)); 
    //all set now logger is accessible via Logger.getLogger
}

Затем, когда вы создаете новый канал, все, что вам нужно, это установить ранее созданный регистратор:

public class Iso8583MessageBOKImpl implements Iso8583Message{
...
        org.jpos.iso.ISOPackager customPackager = new GenericPackager(isoPackagerLocation+iso8583Properties.getPackager());
        BaseChannel channel = new ASCIIChannel(iso8583Properties.getServerIp(), Integer.parseInt(iso8583Properties.getServerPort()), customPackager);// live
        channel.setLogger(Logger.getLogger("Q2"),"connectips-channel");
...
}

Внутренне Logger.getLogger(String name) создает новый регистратор, если нет ранее зарегистрированного регистратора с таким именем, и регистрирует его в Регистрация имен

Последовательные вызовы с тем же именем возвращают ранее созданный. Таким образом, вы создаете файлы только один раз.

Самое главное здесь то, что initLogger вызывается только в начале вашего приложения, например (это не лучший способ, просто пример) в статическом инициализаторе вашего класса, если это единственное место, где вы используете класс, связанный с jpos :

public class Iso8583MessageBOKImpl implements Iso8583Message{

    static {
        initLogger();
    }
...

И последнее, но не менее важное: я настоятельно рекомендую вам использовать Q2 для инициализации объектов jpos, это руководство содержит все необходимое для создания канала и регистратора.

Затем, когда вы хотите отправить сообщение, вам даже не нужно создавать экземпляр канала, просто вызовите методы QMUX.getMUX(mux-name) и QMUX.request(), чтобы отправить сообщение в канал и получить его ответ.