преобразовать itk (файл nifti) в изображение полиданных (.vtk)

Я работаю с базой данных МРТ в формате niftiformat (.nii), но хочу преобразовать их в изображения с полиданными .vtk. Я использовал много разных методов: например, miconv, itksnap, я скачивал vtk, itk и itkvtkglue... Но никто не дал мне хороших результатов. Пожалуйста, помогите мне.


person noura selmi    schedule 10.12.2019    source источник
comment
То, что вы, кажется, ищете, - это сегментация изображений (поищите). Можете ли вы предоставить некоторые исходные данные и результаты (или их скриншоты), которые предоставляет вам ITK-SNAP и т. д., и объяснить, почему вы не удовлетворены результатами?   -  person Dženan    schedule 10.12.2019


Ответы (1)


Если я правильно понимаю, nii файлы представляют собой объемные данные, поэтому вы не можете просто «преобразовать» их в полигональные данные, если не создадите isosurface из него попробуйте:

from vtkplotter import load
vol = load('myfile.nii') #vtkVolume
vol.isosurface().show()
# or convert to vtk format:
vol.write('newfile.vti')
person mmusy    schedule 10.12.2019