Функциональное обогащение не получено, возможно, из-за ошибки в StringApp 1.5.0 и Cytoscape 3.7.2

Я здесь новичок и пытаюсь обойти функциональное обогащение с помощью StringApp (1.5.0) и Cytoscape (3.7.2). Я следую доступному руководству https://cytoscape.org/cytoscape-tutorials/protocols/differenfully-expressed-genes/#/8, но я всегда получаю сообщение об ошибке, что «Поиск обогащения не дал результатов, возможно, из-за ошибки» в Cytoscape. Я пробовал использовать другой учебный набор данных, но проблема все еще возникает.

Кто может помочь?

Спасибо! Мелани


person Mélanie BLANC    schedule 27.12.2019    source источник


Ответы (1)


Я тоже получаю эту ошибку сегодня. Получение белков в Cytoscape через приложение String по-прежнему работает нормально, похоже, это связано именно с функциональным обогащением.

person mlwright    schedule 27.12.2019