Вопросы по теме 'nifti'

Изображение с передискретизацией fsl получается обрезанным
Я использую fsleyes для передискретизации изображения, предоставляя эталонное изображение, но сгенерированное передискретизированное изображение обрезается? синий цвет является повторно дискретизированным оверлеем Я попытался увеличить...
36 просмотров

Преобразование формата .mhd в формат .nii для нескольких файлов код выполняется без ошибок, но преобразование не выполняется
Я использую набор данных slover07, и моя задача - преобразовать изображения формата.mhd в формат .nii. Следуя ответу Данные медицинской визуализации - как конвертировать .raw / mhd в Nifti / nii , мне удалось преобразовать его для одного...
16 просмотров

Сохранение изображений нибабелей с размерами вокселей
Невозможно установить размеры вокселя изображения в NiftiHeader в нибабеле. Как установить определенные размеры вокселя для данного изображения? Мне нужно сохранить изображение с некоторыми конкретными размерами вокселей в нибабеле. image =...
1689 просмотров
schedule 30.03.2022

Как проверить изображение NIFTI в правильной ориентации / положении с помощью Python
Я новенький здесь. В настоящее время изучаю данные медицинской визуализации на Python и задаюсь вопросом, можно ли идентифицировать изображение NIFti в правильной ориентации и как выполнить преобразование. Я поискал в Интернете и нашел алгоритм для...
359 просмотров
schedule 30.04.2022

Как сохранить файлы nii в один файл nii с помощью MATLAB
У меня есть 360 файлов 3D-nifti, я хочу прочитать все эти файлы и сохранить в один файл nifti, используя Инструмент Nifti Analyze , который должен создать 4D-файл большого размера. До сих пор я написал следующие строки clear all; clc;...
3544 просмотров
schedule 21.07.2022

Python: использование NiBabel для записи файлов .hdr / .img nifti
Попытка перейти от dicom к nifti с помощью nibabel. ищу способ сохранить заголовок и изображение по отдельности, все остальное я сделал. nibabel.Nifti1Header имеет функцию write_to, но принимает только fileobj. как передать этому методу экземпляр...
1207 просмотров
schedule 03.08.2023

преобразовать itk (файл nifti) в изображение полиданных (.vtk)
Я работаю с базой данных МРТ в формате nifti format (.nii), но хочу преобразовать их в изображения с полиданными .vtk . Я использовал много разных методов: например, miconv, itksnap, я скачивал vtk, itk и itkvtkglue... Но никто не дал мне хороших...
483 просмотров
schedule 18.05.2023

Метаданные DICOM в Nifti не передаются
Я пытаюсь взять несколько стеков DICOM и преобразовать их в файлы Nifti. Когда я выполняю преобразование и открываю новый файл Nifti в средстве 3D-просмотра, объем разбивается в направлении z. Файлы Nifti не знают, какое расстояние между срезами....
813 просмотров
schedule 26.08.2023

Разделение изображений NIFTI на воксельные патчи
Я пытаюсь разбить набор изображений 3D MRA NIFTI на воксельные участки равного размера (например, 32 x 32 x 32). Цель состоит в том, чтобы использовать воксели для обучения 3D CNN обнаружению аномалий в мозговых артериях. Как этого можно достичь с...
88 просмотров