Публикации по теме 'sequencing'


Как выполнять промисы последовательно
Как выполнять промисы последовательно Если вы кодировали с помощью Javascript, скорее всего, вы использовали промисы в своем коде. Это важно для функционального программирования, а Promise.all , который входит в состав ES6, достаточно для запуска параллельных асинхронных задач. Однако, если вы хотите запускать свои задачи последовательно, вам не повезло с новой библиотекой промисов. Недавно я столкнулся с вариантом использования, когда мне нужно было последовательно вызывать..

Доктор Элиза Вонг
Привет! Кто вы и откуда? Я Элиза, я из Португалии, но родилась в Макао. Какова ваша профессия и как вы в итоге стали ею заниматься? Я ученый NGS, прошедший обучение в международных исследовательских учреждениях. Я защитил докторскую диссертацию по клеточной биологии и молекулярной биологии в Wellcome Trust for Cell Biology в Эдинбурге, где я узнал о своем увлечении нетрадиционными способами проведения скрининга малых молекул против противораковой мишени, теломеразы. Это..

Вопросы по теме 'sequencing'

Последовательность с ++ 17 в назначении: все еще не реализовано в GCC?
Я попробовал следующий код как наивную попытку реализовать замену байтов R и B в слове ABGR #include <stdio.h> #include <stdint.h> uint32_t ABGR_to_ARGB(uint32_t abgr) { return ((abgr ^= (abgr >> 16) & 0xFF) ^= (abgr...
173 просмотров
schedule 09.10.2021

Извлечение нескольких последовательностей из файла fasta размером 7 ГБ с использованием идентификаторов из отдельного текстового файла
После нескольких часов поиска на этом веб-сайте и пробования множества разных вещей, которые не работали, я решил опубликовать свой вопрос. В настоящее время у меня есть текстовый файл (id.txt), который содержит около 100 строк следующих IDS в этой...
369 просмотров

Добавить имя файла в заголовки fasta нескольких файлов fasta внутри цикла
У меня есть 10 файлов fasta (каждый файл с 20 последовательностями генов из каждого из 10 образцов). Я хотел бы создать 20 файлов, специфичных для каждого гена, из 10 образцов. Я поступил следующим образом, чтобы извлечь гены с именем файла в...
769 просмотров
schedule 02.04.2022

Как создать кластер Kubernetes, обслуживающий собственный контейнер с SSL и NGINX
Я пытаюсь построить кластер Kubernetes со следующими сервисами внутри: Docker-registry (который будет содержать мой образ Django Docker) Nginx прослушивает порт 80 и 443 PostgreSQL Несколько приложений django обслуживаются с помощью...
833 просмотров
schedule 16.06.2022

Python: разграничить последовательные регионы
У меня есть .txt, например (вкладки разделены): 1 2345 1 2346 1 2347 1 2348 1 2412 1 2413 1 2414 Первые четыре последовательные строки содержат последовательные целые значения от 2345 до 2348. Точно так же последние три строки содержат...
164 просмотров
schedule 19.07.2023

Внедрение собственной последовательности в рэкет
Мне нужно реализовать функцию, которая принимает одно или несколько выражений и выполняет эти выражения по порядку. Это то, что у меня есть до сих пор: (define (foo exp0 exp1 ) exp0 exp1)
232 просмотров
schedule 08.03.2023

Формат Vcf to Bayescan - скрипт Perl не распознает популяции
Я пытаюсь преобразовать файл .vcf в правильный формат для BayeScan . Я пытался использовать PGDSpider в соответствии с рекомендациями, но мой файл .vcf слишком велик, поэтому возникают проблемы с памятью. Затем я нашел скрипт perl на...
177 просмотров

Snakemake: {input: q} не возвращает ввод в кавычках
Я разрабатываю конвейер ATACseq, используя Genrich для работы со Snakemake. Дело в том, что Genrich позволяет вызывать пики из более чем одной реплики на одном и том же шаге, избегая дополнительных шагов (например, IDR). В Snakemake я нашел способ...
81 просмотров

Вопрос производительности хвостовой рекурсии Haskell для расстояний Левенштейна
Я играю с вычислением расстояний Левенштейна в Haskell и немного расстроен следующей производительностью проблема. Если вы реализуете это наиболее «обычным» способом для Haskell, как показано ниже (dist), все работает просто отлично: dist ::...
655 просмотров

Последовательность работы с указанием времени выполнения работы, сроков и штрафов
Существует N заданий со временем выполнения, сроками и штрафами, если задание не соответствует сроку. Время выполнения, крайний срок и штраф могут варьироваться для каждой работы. За один раз можно выполнить только одну работу. И все работы должны...
1357 просмотров
schedule 31.12.2023

Использование Bash для ручного редактирования текстового файла или файла Fastq
Я хотел бы вручную отредактировать файл Fastq, используя Bash, на несколько похожих строк. В файлах Fastq чтение последовательности начинается со строки 2, а затем встречается в каждой четвертой строке (т.е. строки 2, 6, 10, 14...). Я хотел бы...
545 просмотров
schedule 23.02.2024