Вопросы по теме 'simpleitk'
Чтение объема 3D DICOM в Python дает sitk :: ERROR: файл в серии имеет неподдерживаемые 3 измерения
Я использую SimpleITK на Python 3.7.3 на Anaconda Spyder на CentOS 7. Я также установил Aliza и пытаюсь прочитать образец тома /usr/share/aliza/datasets/DICOM/00_MR/PS_0.dcm в Python для обработки это с numpy. Однако следующий код Python.
import...
479 просмотров
schedule
11.05.2022
simpleITK N4BiasFieldCorrection работает странно с точки зрения скорости работы и результатов
Я делаю проект о сегментации опухоли головного мозга. И когда я применяю N4BiasCorrection к своему файлу (.mha), я использовал методы slicer и simpleITK. Slicer работает хорошо, но отнимает много времени, потому что я не знаю, как использовать код...
636 просмотров
schedule
10.05.2023
sudo easy_install для SimpleITK не так просто
Итак... Я пробовал несколько способов загрузить SimpleITK (установка pip) на Python, но он вообще не работает! (Здесь: проблема установки SimpleITK python 2.7.12 ) Теперь я m с помощью easy_install, и я получаю эту ошибку:
Searching for...
263 просмотров
schedule
24.09.2023
Не удается записать образ SimpleElastix (Python)
Я пытаюсь запустить следующий пример как часть библиотеки SimpleElastix :
import SimpleITK as sitk
elastixImageFilter = sitk.ElastixImageFilter()
elastixImageFilter.SetFixedImage(sitk.ReadImage('1.jpg', sitk.sitkFloat32))...
1501 просмотров
schedule
05.05.2023
SimpleITK Изменение размера изображений
У меня есть набор трехмерных томов, которые я читаю с SimpleITK
import SimpleITK as sitk
for filename in filenames:
image = sitk.ReadImage(filename)
Каждый из томов имеет разный размер, интервал, происхождение и направление. Этот код...
8139 просмотров
schedule
20.02.2023
simple-itk: чтение последовательности из одного файла TIFF
У меня есть tif-файл, содержащий серию изображений. Это трехмерный объем пикселей, созданный с помощью компьютерной томографии.
Но после прочтения изображения с помощью simple-itk остается только один слой:
reader = sitk.ImageFileReader()...
477 просмотров
schedule
22.12.2022
Как выполнить пороговое значение?
Когда я применяю пороговое значение, я получаю сообщение об ошибке:
import SimpleITK as sitk
img = sitk.ReadImage("Sub1.png")
img=img>20
Ошибка:
RuntimeError Traceback (most recent call last)...
308 просмотров
schedule
29.07.2023
SimpleITK для регистрации изображений. Проблема с записью
Я установил из исходников пакет SimpleITK на Python3. Когда я выполняю предоставленный пример регистрации:
#!/usr/bin/env python
#=========================================================================
#
# Copyright NumFOCUS
#
# Licensed...
581 просмотров
schedule
14.08.2023
Преобразование значения пикселя изображения Dicom в цвет Unity
Я использую SimpleITK для чтения образа Dicom в Unity. Я создаю список Unity Texture2D для хранения фрагментов Dicom. У меня вопрос: как преобразовать значение пикселя из изображения Dicom в Unity Color?
List<Texture2D>...
64 просмотров
schedule
13.04.2023
Сохранение вектора со сложными компонентами в nifti-файле
Я генерирую 4D сложный массив numpy, например:
numpy_array = np.tile(np.array([3, 4, 0], dtype=np.complex64), (100,100,100,1))
я хочу сохранить массив numpy как файл nifti
Я пробовал использовать vtk и SimpleITK, но оба они не поддерживают...
477 просмотров
schedule
04.02.2024