Я пытаюсь создать контейнер сингулярности, чтобы запустить скрипт Python в кластере на основе CentOS 7. Контейнер работает должным образом на моем хосте, который я также использовал для создания контейнера, но дает сбой в кластере, как только PyTorch...

Я пытаюсь создать образ для Singularity, используя следующий файл (это Singularity.recepie ): Bootstrap: docker From: ubuntu:18.04 %post apt-get -y update apt-get install -y python3-pip %files QC.py / %runscript...

Для развертывания в кластере я упаковываю академическое программное обеспечение под названием LEERJS в контейнер Singularity. Он поставляется с предварительно собранными пакетами Matlab, которые запускаются из программного обеспечения. Я установил...

Я использую контейнеры Singularity для запуска команд из системы управления рабочим процессом Nextflow. У меня есть среда conda внутри Singularity, которую я могу активировать, когда помещаю оболочку в контейнер singularity pull...

Я попытался создать контейнер сингулярности из Singularity Hub как таковой: sudo singularity pull shub://marcc-hpc/pytorch И я получил ERROR : Called singularity_config_get_value on uninitialized config subsystem . Итак, я скопировал,...

Я хочу использовать Docker для изоляции научных приложений для использования в кластере HPC Unix. Научное программное обеспечение часто имеет экзотические зависимости, поэтому изоляция их с помощью Docker кажется хорошей идеей. Программы должны...

Я хочу войти в контейнер с особенностями, а затем запустить команды slurm. Например: singularity shell docker://tensorflow/tensorflow:1.0.0-gpu-py3 затем внутри него запустите сценарий, который я действительно хочу запустить: python...

Я знаю, как запустить сингулярность: singularity run /mn/sarpanitu/singularity/test/fenics-and-more.img Есть ли способ сделать одну строку (или больше) для запуска предыдущей команды, а затем в сингулярности запустить echo "hi there" ?...

Я новичок в Docker и Singularity. Недавно я создал канонический main.c . #include <stdio.h> #include <stdlib.h> int main(void){ printf("Hello Docker World!\n"); return 0; } Я статически скомпилировал этот код, т.е....

Я уже некоторое время использую Singularity 2.6 и недавно обновил свою Singularity до 3.0 (я не могу перейти на 3.0 .3 по техническим причинам). Используя Singularity 3.0, я создаю свой новый контейнер с тем же файлом точного определения, который...

docker build \ --tag gcr.io/fuzzbench/runners/afl/libpng-1.2.56-intermediate \ --build-arg BUILDKIT_INLINE_CACHE=1 \ --cache-from gcr.io/fuzzbench/runners/afl/libpng-1.2.56-intermediate \ --file fuzzers/afl/runner.Dockerfile \...

Я создал контейнер докеров для своей программы на чистом Python и установил python main.py , который будет выполняться при запуске контейнера. Запуск контейнера на моем локальном компьютере работает должным образом. Однако я хочу запустить...

не могли бы вы посоветовать: учитывая контейнер сингулярности, как я могу скопировать файлы с локального диска в контейнер сингулярности? Я использую контейнер сингулярности, описанный по адресу: https://hub.docker.com/r/tobneu/slamdunk...