Почему я получаю X. в именах столбцов при чтении фрейма данных?

read.csv() — это оболочка более общей функции read.table(). Эта последняя функция имеет аргумент check.names, который задокументирован как:

check.names: logical.  If ‘TRUE’ then the names of the variables in the
         data frame are checked to ensure that they are syntactically
         valid variable names.  If necessary they are adjusted (by
         ‘make.names’) so that they are, and also to ensure that there
         are no duplicates.

Если ваш заголовок содержит метки, которые синтаксически недействительны, то make.names() заменит их допустимым именем на основе недопустимого имени, удалив недопустимые символы и, возможно, добавив X:

R> make.names("$Foo")
[1] "X.Foo"

Это задокументировано в ?make.names:

Details:

    A syntactically valid name consists of letters, numbers and the
    dot or underline characters and starts with a letter or the dot
    not followed by a number.  Names such as ‘".2way"’ are not valid,
    and neither are the reserved words.

    The definition of a _letter_ depends on the current locale, but
    only ASCII digits are considered to be digits.

    The character ‘"X"’ is prepended if necessary.  All invalid
    characters are translated to ‘"."’.  A missing value is translated
    to ‘"NA"’.  Names which match R keywords have a dot appended to
    them.  Duplicated values are altered by ‘make.unique’.

Поведение, которое вы видите, полностью соответствует задокументированному способу read.table() загрузки ваших данных. Это предполагает, что у вас есть синтаксически недопустимые метки в строке заголовка вашего CSV-файла. Обратите внимание на пункт выше из ?make.names о том, что буква зависит от локали вашей системы; Файл CSV может содержать допустимый символ, который будет отображаться в вашем текстовом редакторе, но если R не работает в той же локали, например, этот символ может быть недопустимым?

Я бы посмотрел файл CSV и определил любые символы, отличные от ASCII, в строке заголовка; возможно, в строке заголовка также есть невидимые символы (или escape-последовательности; \t?). Между чтением файла с недопустимыми именами и его отображением в консоли может происходить многое, что может маскировать недопустимые символы, поэтому не принимайте тот факт, что он не показывает ничего неправильного без check.names как указание на то, что файл в порядке.

Также было бы полезно опубликовать вывод sessionInfo().

Я только что столкнулся с этой проблемой, и это было по простой причине. У меня были метки, которые начинались с цифры, и R добавлял X перед ними всеми. Я думаю, что R путают с числом в заголовке и применяют букву, чтобы отличать значения.

Итак, «3_in» стало «X3_in» и т. д. Я решил, переключив метку на «in_3», и проблемы были решены.

Я надеюсь, что это поможет кому-то.

Я столкнулся с похожей проблемой и хотел поделиться следующими строками кода, чтобы исправить имена столбцов. Конечно, не идеально, так как чистое программирование в форхенде было бы лучше, но может быть полезно в качестве отправной точки для кого-то как быстрый и грязный подход. (Я хотел бы добавить их в качестве комментария к вопросу Райана/ответу Гэвина, но моя репутация недостаточно высока, поэтому мне пришлось опубликовать дополнительный ответ - извините).

В моем случае несколько шагов записи и чтения данных создали один или несколько столбцов с именами «X», X.1»,..., содержащих содержимое в столбце X и номера строк в столбцах X.1,.... В моем случае содержимое столбца X следует использовать в качестве имен строк, а другие столбцы X.1,... следует удалить.

Correct_Colnames <- function(df) {

 delete.columns <- grep("(^X$)|(^X\\.)(\\d+)($)", colnames(df), perl=T)

  if (length(delete.columns) > 0) {

   row.names(df) <- as.character(df[, grep("^X$", colnames(df))])
   #other data types might apply than character or 
   #introduction of a new separate column might be suitable

   df <- df[,-delete.columns]

   colnames(df) <- gsub("^X", "",  colnames(df))
   #X might be replaced by different characters, instead of being deleted
  }

  return(df)
}

Когда имена столбцов имеют неправильную форму, R помещает «X» в начале имени столбца во время импорта. Например, это обычно происходит, когда имена ваших столбцов начинаются с цифры или какого-либо пробела. Причина check.names = FALSE не произойдет - не будет "Х". Однако некоторые функции могут не работать, если имена столбцов начинаются с цифр или других специальных символов. Примером является функция rbind.fill.

Итак, после применения этой функции (с «исправленными именами столбцов») я использую эту простую вещь, чтобы избавиться от «X».

destroyX = function(es) {
  f = es
  for (col in c(1:ncol(f))){ #for each column in dataframe
    if (startsWith(colnames(f)[col], "X") == TRUE)  { #if starts with 'X' ..
      colnames(f)[col] <- substr(colnames(f)[col], 2, 100) #get rid of it
    }
  }
  assign(deparse(substitute(es)), f, inherits = TRUE) #assign corrected data to original name
}

Я решил аналогичную проблему, включив row.names=FALSE в качестве аргумента в функцию write.csv. write.csv включал имена строк как безымянный столбец в CSV-файле, а read.csv называл этот столбец «X» при чтении CSV-файла.