Ошибка JRI моста Java-R: R уже инициализирован

Я использую JRI в качестве ведомого для расчета статистики из Java. Вычисления R требуются время от времени, но не слишком часто. Таким образом, я решил создать метод-оболочку для вычислений, который создает новый экземпляр REngine, а также закрывает его в конце. Все работает как шарм при первом вызове метода. К сожалению, повторный вызов вызывает ошибку «R уже инициализирован».

Инициализация:

private static Rengine createEngineInstance(){

        //Initialise R Engine. 
        Rengine re=new Rengine (new String [] {"--vanilla"}, false, new CallbackListener());

        //Wait until REngine-thread is ready
        if (!re.waitForR())
        {
            System.err.println ("Cannot load R. Is the environment variable R_HOME set correctly?");
            System.exit(1);
        }
        return re;
}

Метод обертки:

public static void performR(){

    //Create instance of R engine
    Rengine re = createEngineInstance();

    //Perform some R operations
    re.eval("...");

    re.end();

}

Очевидно, что экземпляр REngine не завершается корректно. Таким образом, мне нужно знать: 1) Есть ли возможность завершить работу REngine и позже снова создать новый экземпляр? Как это работает правильно? Я знаю, что с JRI невозможно запустить несколько потоков R одновременно, но это не то, к чему я стремлюсь. 2) Если это не так, я бы создал один экземпляр, используя шаблон Singleton. Как в этом случае я могу гарантировать, что сеанс R будет закрыт при завершении программы?

Ваша помощь очень ценится! Спасибо!


r java singleton jri
person Chris    schedule 09.05.2014    source источник
comment
Хотя это не тот ответ, который вы ожидали, попробуйте использовать renjin renjin.org, он не использует R интерпретатор, так что у вас не будет такой проблемы (хотя есть и другие проблемы с этим...)   -  person Yehoshaphat Schellekens    schedule 12.05.2014

Ответы (2)


arrow_upward
7
arrow_downward

согласно JRI Javadoc....

Можно использовать только один экземпляр Rengine, и функция Reengine.end() имеет некоторые проблемы...

вы не должны использовать такой код

Rengine engine = new Rengine(new String[] {"--vanilla"}, false, null);

вы можете использовать Reengine с этим кодом

Rengine engine = Rengine.getMainEngine();
if(engine == null)
    engine = new Rengine(new String[] {"--vanilla"}, false, null);
person user3741031    schedule 14.06.2014

arrow_upward
2
arrow_downward

Очень старый вопрос, но я бы добавил, что рассмотрение RServe в качестве альтернативы часто бывает привлекательным. Настройка менее сложная (на мой взгляд), а интерфейс почти идентичен.

Подробное руководство приведено здесь. (обратите внимание, что это ссылка waybackmachine (архив), поскольку исходная ссылка устарела - она ​​может загружаться немного медленно, но должна продолжать работать).

Это дает дополнительные преимущества: если вы когда-нибудь захотите вызывать R из параллельных потоков Java, вы сможете это сделать.

person kabdulla    schedule 17.11.2016
comment
Еще очень ценится. Спасибо! - person Chris; 18.11.2016
comment
Ссылка не работает. - person Emadpres; 04.06.2021
comment
@Emadpres, спасибо, что сообщили мне. Я заменил ссылку на waybackmachine. Я также начал вставлять информацию из этого урока сюда, но он довольно длинный. Мы надеемся, что ссылка WBM не сломается. - person kabdulla; 05.06.2021