Я пытаюсь понять, как агрегировать мой вывод. Я создал некоторые фиктивные данные, которые аппроксимируют мои фактические данные, а именно: сотни групп group1, 3 уровня группы2 и несколько десятков логических проверок. Извините, если это кажется простым, я много охотился и клевал, и должен сказать, что, будучи новичком в R, огромное разнообразие инструментов (семейство приложений, ddply, агрегат, таблица, изменение формы и т. д.) одновременно прекрасно и немного страшно :)
#create data
group1 <- paste("Group", rep(LETTERS[1:7], sep=''))
group2 <- c("UNC", "UNC", "SS", "LS", "LS", "SS", "UNC")
valid1 <- c("Y", "N", NA, "N", "Y", "Y", "N")
valid2 <- c("N", "N", "Y", "N", "N", "Y", "N")
valid3 <- c(1.4, 1.2, NA, 0.7, 0.3, NA, 1.7)
valid4 <- c(0.4, 0.3, 0.53, 0.66, 0.3, 0.3, 0.71)
valid5 <- c(8.5, 11.2,NA, NA, 8.3, NA, 11.7)
testdata <- data.frame(cbind(group, group2, valid1, valid2, valid3, valid4, valid5))
valid <- function(testdata){
for(i in group)
val1 <- ifelse(valid1=="Y", 1,0)
val2 <- ifelse(valid2=="Y", 1,0)
val3 <- ifelse(valid3>=1.0, 1,0)
val4 <- ifelse(valid4<=0.5, 1,0)
val5 <- ifelse(valid5>=10.0, 1,0)
test.out <- data.frame(cbind(group1,group2, val1, val2, val3, val4, val5))
}
validtry <- valid(testdata)'
Затем мне нужно преобразовать эти логические выражения в числовые, чтобы их можно было суммировать:
#make validations numeric
# why doesn't this work:
# validtry[,3:7] <- as.numeric(validtry[,3:7])
#but these do
validtry[,3] <- as.numeric(validtry[,3])
validtry[,4] <- as.numeric(validtry[,4])
validtry[,5] <- as.numeric(validtry[,5])
validtry[,6] <- as.numeric(validtry[,6])
validtry[,7] <- as.numeric(validtry[,7])
######
#summarize validtry
#sum on both groups
aggregate(validtry[,3:7], by=list(validtry$group1, validtry$group2), sum, na.rm=T)
#sum on one group
aggregate(validtry[,3:7], by=list(validtry$group2), sum, na.rm=T)
Итак, эти два последних сближают меня, но я думаю, что мне нужно что-то другое? Я пытаюсь суммировать строки и столбцы для двух групп. Я знаком с tapply, но, похоже, не понимаю.
заранее спасибо!!
data.frame(cbind(..
, вместо этогоtestdata <- data.frame(group1, group2, valid1, valid2, valid3, valid4, valid5)
- person akrun   schedule 06.09.2014as.numeric
для суммирования логических векторов. Они имеют числовые значения 0 для FALSE и 1 для TRUE. - person Rich Scriven   schedule 06.09.2014group1
. Это «group1» при создании, а затем просто «group». Энди, если вы не скажете, каковы правильные ответы, то цель суммирования по строкам и столбцам для двух групп слишком расплывчата, чтобы знать, как ее правильно реализовать. - person IRTFM   schedule 06.09.2014group1
есть семь уникальныхlevels
. Ваш примерный набор данныхnrow
равен 7. Таким образом, среднее значение будет7
значений для каждогоvalid
столбца. Непонятно, чего вы ожидаете в результате. Было бы проще, если бы вы также показали ожидаемый результат. - person akrun   schedule 06.09.2014