Порядок филогенетических узлов

Я делаю несколько графиков в R, используя лингвистическую филогению. Я хочу построить ряд квадратов после конечного узла филогении и раскрасить их, чтобы представить ряд переменных.

Я создал квадраты, но не могу раскрасить их в правильном порядке.

Объект «фило» упорядочивает метки узлов в алфавитном порядке, однако они не отображаются в алфавитном порядке. Есть ли способ получить порядок меток наконечников в том порядке, в котором они нанесены на филогению (сверху вниз или снизу вверх)?

Спасибо,

Сэм


r plot phylogeny
person SamPassmore    schedule 23.10.2014    source источник
comment
Привет, не могли бы вы поделиться некоторым кодом, используемыми пакетами или создать минимальный рабочий пример, спасибо   -  person user20650    schedule 23.10.2014
comment
Привет, я искал филогенез, который имеет тот же состав, что и тот, который я использую. К сожалению, я не могу поделиться своими точными данными. После поиска я обнаружил, что моя филогения может быть в необычном формате, поэтому мне может потребоваться некоторое время, чтобы организовать рабочий пример. Извинения.   -  person SamPassmore    schedule 24.10.2014

Ответы (1)


arrow_upward
0
arrow_downward

Если вы сохраните филогению в файл и прочитаете ее снова, метки кончиков должны быть сброшены и будут в том порядке, в котором они появляются при построении графика.

person William Gearty    schedule 11.03.2015