Я знаю, что могу использовать алгоритмы деконволюции, такие как LUCY, Weiner и Вслепую, но я не понимаю, как оценить PSF (функция распределения точек), которая необходима для алгоритмов LUCY и Weiner. В настоящее время я использую установку для микроскопии Widefield Florescence.
Я читал во многих местах в Интернете, что флуоресцентная бусина представляет собой объект с низким разрешением и, следовательно, импульсную функцию. Хотя я понимаю, что OTF (оптическая передаточная функция) представлена изображением, которое я получаю, как мне наложиться на деконволюцию изображения, которое у меня есть, используя то же самое изображение?
Вот пример изображения, которое я пытаюсь развернуть:
У меня есть программа, которая автоматически выделяет бусину и обрезает остальную часть изображения. Все, что мне нужно сделать, это применить к этому деконволюцию.
Моя конечная цель — получить оптическое сечение путем деконволюции набора 2D-срезов, которые я получил из видео, и представления их с помощью программного обеспечения для 3D.
Так может кто-нибудь объяснить, что мне нужно сделать, либо теоретически (или с точки зрения MATLAB, что было бы предпочтительнее).
Одно из возможных решений
Поговорив с несколькими людьми, я заметил, что у EPFL есть ресурс Java, который можно вызывать из МАТЛАБ. Это генератор PSF, основанный на спецификациях вашего микроскопа. Этот сгенерированный PSF можно использовать с LUCY и Weiner.
Альтернативное решение
Я также нашел этот ресурс , которая представляет собой библиотеку MATLAB, посвященную тому, над чем я сейчас работаю.
Это (мне бы очень понравилось, если бы кто-то тоже попытался ответить на этот вопрос) — так я буду измерять производительность алгоритмов деконволюции. Я считаю, что конечный результат моей деконволюции будет зависеть от оценки PSF (ресурс EPFL или алгоритм Правина) и алгоритма деконволюции (слепой, LUCY, Weiner и т. д.). Я опубликую таблицу всех результатов здесь, как только это будет сделано.