Я пытаюсь использовать обычный кригинг для пространственного прогнозирования данных о местонахождении животного на основе переменных-предикторов с использованием пакета gstat или automap в R. У меня много (более 100) повторяющихся точек координат, которые я не могу выбросить, так как эти станции были выбраны. многократно в течение многих лет. Каждый раз, когда я запускаю приведенный ниже код для обычного кригинга, я получаю ошибку LDL из-за повторяющихся точек. Кто-нибудь знает, как решить эту проблему, не выбрасывая данные? Я попробовал код из пакета automap, который должен исправлять дубликаты, но я не могу заставить его работать. Спасибо вам за помощь!
coordinates(fish) <- ~ LONGITUDE+LATITUDE
x.range <- range(fish@coords[,1])
y.range <- range(fish@coords[,2])
grd <- expand.grid(x=seq(from=x.range[1], to=x.range[2], by=3), y=seq(from=y.range[1], to=y.range[2], by=3))
coordinates(grd) <- ~ x+y
plot(grd, pch=16, cex=.5)
gridded(grd) <- TRUE
library(gstat)
zerodist(fish) ###146 duplicate points
v <- variogram(log(WATER_TEMP) ~1, fish, na.rm=TRUE)
plot(v)
vgm()
f <- vgm(1, "Sph", 300, 0.5)
print(f)
v.fit <- fit.variogram(v,f)
plot(v, model=v.fit) ####In fit.variogram(v, d) : Warning: singular model in variogram fit
krg <- krige(log(WATER_TEMP) ~ 1, fish, grd, v.fit)
## [using ordinary kriging]
##"chfactor.c", line 131: singular matrix in function LDLfactor()Error in predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block, nsim = nsim,: LDLfactor
##automap code for correcting for duplicates
fish.dup = rbind(fish, fish[1,]) # Create duplicate
coordinates(fish.dup) = ~LONGITUDE + LATITUDE
kr = autoKrige(WATER_TEMP, fish.dup, grd)
###Error in inherits(formula, "SpatialPointsDataFrame"):object 'WATER_TEMP' not found
###somehow my predictor variables are no longer available when in a Spatial Points Data Frame??
library
вызов (или ссылку), который делаетfish
доступным. - person IRTFM   schedule 04.02.2016