метка оси x вращающейся дендрограммы в R

Я даю пример данных, предоставленных hclust справкой:

mds2 <- -cmdscale(UScitiesD)
hcity.D <- hclust(UScitiesD, "ward.D")
plot(hcity.D,  hang=-1)

Когда вы рисуете это, метки сайтов расположены вертикально, что подходит для этого примера, поскольку они используют длинные имена. Однако мои данные помечены просто A1, A2 и т. д., и когда я строю график, кажется ненужным иметь вертикальную маркировку.

Я знаю, что для вертикальной дендрограммы las=2 и srt = 90 могут также вращать метки оси Y в text(), но это не влияет на метки на этом графике hclust.

Как я могу повернуть метки сайта, чтобы они были горизонтальными для этого графика?

Спасибо


r data-visualization hclust dendrogram dendextend
person Birdonawire    schedule 13.02.2017    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
0
arrow_downward

Вы можете решить эту проблему, используя следующий код, просто измените srt на то, что хотите (обратите внимание, что вам понадобится dendextend пакет R):

mds2 <- -cmdscale(UScitiesD)
hcity.D <- hclust(UScitiesD, "ward.D")
dend <- as.dendrogram(hcity.D)

# install.packages("dendextend")
library(dendextend)
dend_labels <- labels(dend)
labels(dend) <- ""
plot(dend)
text(x = 1:length(dend_labels), labels = dend_labels, srt = 45, adj = c(1,1), xpd = T)

введите здесь описание изображения

person Tal Galili    schedule 14.02.2017