Перекрестные ссылки между слайдами и их содержанием

Для ссылки на приложение вы можете использовать

- Bullet 3: \hyperlinkappendixstart{appendix}

Если вы изучите код tex, созданный вашим MWE, вы увидите, что ваша таблица и рисунок включены без заголовка или среды _2 _ / _ 3_, но вы можете ссылаться на слайд, на котором они находятся

- Bullet 1: \hyperlink{table}{table}
- Bullet 2: \hyperlink{plot}{plot}

MWE:

---
title: "Cross references between slides"
output:
  beamer_presentation:
    theme: "default"
    keep_tex: true
    includes:
      in_header: preamble.tex    

---


```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE)
```

## Bullets with references

- Bullet 1: \hyperlink{table}{table}
- Bullet 2: \hyperlink{plot}{plot}
- Bullet 3: \hyperlinkappendixstart{appendix}


## table


```{r my-table, cars, echo = TRUE}
library(kableExtra)
kable(summary(cars))
```

## plot


```{r my-plot, pressure}
plot(pressure)
```

## appendix
\appendix
my appendix

Подход 2

или вы можете использовать пакет caption для добавления подписей к вашим таблицам и графикам

---
title: "Cross references between slides"
output:
  beamer_presentation:
    theme: "default"
    keep_tex: true
    includes:
      in_header: preamble.tex    

---


```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE)
```

## Bullets with references

- Bullet 1: \ref{foo}
- Bullet 2: \ref{bar}
- Bullet 3: \hyperlinkappendixstart{appendix}


## table


```{r my-table, cars, echo = TRUE}
library(kableExtra)
kable(summary(cars))
```
\captionof{table}{foo}
\label{foo}

## plot


```{r my-plot, pressure}
plot(pressure)
```
\captionof{figure}{bar}
\label{bar}

## appendix
\appendix
my appendix

используя это как preamble.tex:

\setbeamertemplate{caption}[numbered]
\usepackage{caption}