Публикации по теме 'bioinformatics'


Прорыв в будущее программирования: 3 лучших навыка программирования для биоинформатики
Биоинформатика, быстро развивающаяся область на стыке биологии, информатики и анализа данных, революционизирует то, как мы понимаем и используем биологическую информацию. С ее приложениями в геномных исследованиях, персонализированной медицине и биоинженерии биоинформатика предлагает захватывающие возможности для программистов, стремящихся изменить биологию. В этой статье мы рассмотрим три основных навыка программирования, необходимых для того, чтобы прорваться в будущее программирования с..

Сегментация биомедицинских изображений с использованием U-Net
Целью биомедицинской сегментации является обнаружение различных анатомических структур на изображениях. Это ключевая вспомогательная технология для медицинских приложений, таких как диагностика, планирование и руководство. Поэтому за последние несколько лет было опубликовано несколько методов, посвященных сегментации биомедицинских изображений. В этом проекте я использовал архитектуру U-Net [1] для сегментации поражений на КТ легких. U-Net — это полностью сверточная нейронная сеть,..

На этой неделе в TBP #4: GWAS и полигенное ожирение | Обучение подкреплению и противораковые соединения
Классификация глубокого обучения + SNP GWAS "Бумага" Полногеномные ассоциативные исследования являются важным инструментом для исследователей, поскольку они позволяют им выявлять варианты, связанные с интересующими фенотипами. Как правило, большое количество SNP исследуется индивидуально, значение p извлекается и корректируется, а последующий подробный анализ выполняется для придания смысла найденным SNP. Однако моделирование взаимодействия между SNP обычно не встроено в конвейеры...

Эпоха машинного обучения для проектирования белков, обобщенная в четырех ключевых методах
Никогда не было таких захватывающих времен для белковой биотехнологии благодаря этим методам и инструментам, основанным на искусственном интеллекте. Дизайн и инженерия белков являются важными задачами молекулярной биологии с широким спектром приложений в различных областях, включая медицину, биотехнологию и материаловедение. Ученые уже несколько десятилетий изучают различные подходы к разработке новых белков и инженерии существующих для тонкой настройки их свойств. В то время как..

Холангиокарцинома: CDKN2A и MDM2 [1]
В сообщении « Холангиокарцинома: неясное взаимодействие » я упомянул, что сигнальный путь KEGG имеет недокументированное взаимодействие, как показано ниже. CDKN2A* // MDM2 И я решил найти способ объяснить взаимодействие между этими двумя сущностями. Я делаю небольшое отступление, чтобы изучить способы использования обработки естественного языка (NLP) для извлечения и анализа текста, который можно использовать для этой цели. В этом посте я расскажу, как получить представление о..

Новые Stem Skills для изучения на Hyperskill в апреле
Введение Добро пожаловать в ежемесячные обновления контента Гиперскилл ! В этой статье будут представлены новые образовательные темы, проекты и курсы от JetBrains Academy и Edvancium . Наступил апрель, а вместе с ним и уникальная возможность отправиться в образовательное путешествие. Если вы рассматривали возможность изучения новых направлений и проектов в области программирования, математики или биоинформатики, то вам повезло! Кто мы Hyperskill — это проектная учебная..

Когда математика встречается с бионаукой: значение науки о данных
Это была здоровая дискуссия с моим директором, когда я выбирал между математикой и биологией после зачисления. Математика всегда была у меня на нервах вместе со специями компьютерных приложений в те школьные годы, она добавляла гораздо больше вкуса, хотя я выбрала биологию, так как чувствовала, насколько увлекательно знать о том, что находится внутри вашего тела. Теперь, сегодня я могу связать оба аспекта, если вы глубоко погрузитесь в человеческое тело, это предоставит вам большой объем..