Вопросы по теме 'circlize'

Диаграмма хорды R по кругу с логарифмической шкалой
Можно ли в пакете circlize сделать диаграмму хорды, отображающую значения log10? Пока мне удалось создать график со ссылками правильного размера, но соответствующая ось не будет совпадать. ось отображает сумму всех ссылок / зарегистрированных...
550 просмотров
schedule 01.12.2021

Схема аккордов с прозрачными ссылками
У меня есть матрица смежности 8x8, которая выглядит следующим образом: Мне нужно визуализировать только некоторые связи в моей диаграмме аккордов, сохраняя все 8 секторов. Я попытался воспроизвести приведенные здесь инструкции: R Circlize,...
292 просмотров
schedule 06.10.2021

Добавьте процентные метки внутри столбцов в circos.barplot в Circlize
Мне удалось создать столбчатую диаграмму с накоплением следующим образом: library(circlize) library(vegan) # for `reorder.hclust` (may be masked by the library `seriation`) library(dendextend) # for `color_branches` t=read.table(text="Kalmyk...
33 просмотров
schedule 16.09.2021

R Circlize Обнаружить, что некоторые промежутки слишком велики
Я хотел бы сделать аналогичный график, размещенный здесь , однако, используя наши данные, я получил это сообщение об ошибке «Обнаружено, что некоторые промежутки слишком велики». Как вы думаете, потому что некоторые значения очень малы по сравнению...
2851 просмотров
schedule 01.06.2022

Ошибки добавления трека геномных признаков в circlize
Я пытаюсь создать цирковой сюжет с простой геномной нотацией из файлов BED. Однако, когда я использую circos.genomeRect , это приводит к ошибке или к дорожке, которая отображает не прямоугольники, а полукруги, как показано ниже. Рассмотрим...
99 просмотров
schedule 29.05.2022

Повернуть метки на хордовой диаграмме (R по кругу)
Вот некоторый код из пакета circlize для создания хордовой диаграммы. Прямо сейчас метки параллельны краю круга. Можно ли повернуть метки на 90 градусов, чтобы они были перпендикулярны кругу? library(circlize) set.seed(999) mat =...
5444 просмотров
schedule 17.01.2023

r хордовая диаграмма circlize --› вращающиеся имена
Я пишу, потому что я хотел бы получить помощь с графиком в R, используя пакет circlize, пожалуйста. Я пытаюсь сделать диаграмму аккордов, и я мог бы сделать это, но названия на графике перекрываются, затем я попробовал с кодом, который я...
890 просмотров
schedule 14.11.2022

Маркировка круговой dendextend дендрограммы
Я пытаюсь построить круговую дендрограмму композиционных данных. Используя следующий код: library(dendextend) library(circlize) library(compositions) data("Hydrochem") hydro<-Hydrochem d <- dist(hydro[7:19], method="euclidean") hc <-...
412 просмотров
schedule 31.01.2023

Как увеличить круговую дендрограмму в R?
У меня есть круговая дендрограмма в R, и я хочу увеличить ее. Как я могу продолжить? Вот он: Был использован следующий код: library(dendextend) library(circlize) load(file = "hc1.rda") #out1 <- cutree(hc1, k = 50) load(file =...
218 просмотров
schedule 12.03.2023

Круговой график — гистограммы с одинаковой осью Y
Я использую pakage circlize для рисования гистограмм двух разных кроватей (кадров данных). Я мог бы сделать гистограммы на двух разных треках, используя функцию «circos.trackHist», но я не могу их сравнить, потому что они имеют разные масштабы по оси...
93 просмотров
schedule 26.02.2023