Я пытаюсь пометить свою дендрограмму, используя назначенные имена строк из моего набора данных. Я использую пакет: hybridHclust со следующим кодом. Образец таблицы (НАБОР ДАННЫХ, надеюсь, я использую правильный формат) UID Condition1...

Я хотел бы создать дендрограмму в R с цветными ветвями, как показано ниже. До сих пор я использовал следующие команды для создания стандартной дендрограммы: d <- dist(as.matrix(data[,29])) # find distance matrix hc <- hclust(d)...

Я хочу установить цвет ветвей моей дендрограммы с учетом назначенных вручную групп моих листьев. Поэтому я заранее знаю, что хочу раскрасить, например. листья A-C красного цвета, и все ветви, ведущие только к красным листьям, также должны быть...

Рассмотрим простую дендрограмму вроде dend <- 1:5 %>% dist %>% hclust %>% as.dendrogram Как я могу аннотировать расстояние (высоту) на узлах? Я просмотрел пакет dendextend , но он не предлагает такой возможности. Однако я знаю,...

Я хотел бы свернуть ветви dendrogram с учетом ограничения допуска. Я использую collapse_branch пример от dendextend . require(dendextend) dend <- iris[1:5,-5] %>% dist %>% hclust %>% as.dendrogram dend %>% ladderize...

Я даю пример данных, предоставленных hclust справкой: mds2 <- -cmdscale(UScitiesD) hcity.D <- hclust(UScitiesD, "ward.D") plot(hcity.D, hang=-1) Когда вы рисуете это, метки сайтов расположены вертикально, что подходит для этого...

Я пытаюсь использовать замечательный R-пакет с именем dendextend, чтобы построить дендрограмму и раскрасить ее ветви и метки в соответствии с набором ранее определенных групп. Я прочитал ваши ответы в Stack Overflow и часто задаваемые вопросы о...

Я пытаюсь построить круговую дендрограмму композиционных данных. Используя следующий код: library(dendextend) library(circlize) library(compositions) data("Hydrochem") hydro<-Hydrochem d <- dist(hydro[7:19], method="euclidean") hc <-...

У меня есть круговая дендрограмма в R, и я хочу увеличить ее. Как я могу продолжить? Вот он: Был использован следующий код: library(dendextend) library(circlize) load(file = "hc1.rda") #out1 <- cutree(hc1, k = 50) load(file =...

Я попросил нескольких разных экспертов отсортировать 92 объекта на основе их сходства. На основе их ответов я построил матрицу несходства 92 х 92. в R я исследовал эту матрицу с помощью следующих команд: cluster1 <-...

Используя пример, расположенный здесь https://www.datacamp.com/community/tutorials/hierarchical-clustering-R и данные, расположенные https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/seeds# я пытаюсь удалить метки внизу дендрограммы при использовании...

Я использую Identify для изучения специфических особенностей кластеров в дендрограмме в R. Идентификация работает отлично, используя объект hclust, но мне он нужен для горизонтальной дендрограммы класса dendrogram . из "hclust". У меня установлен...

Я работаю над дендрограммой plot(clust.res, hang=-1, main=dedro,labels=data1$Name.of.the.variety) Затем я получаю следующие сообщения: Warning messages: "labels" is not a graphical parameter