Публикации по теме 'genetics'


Использование Python для анализа генома
Разгадывая тайны жизни Анализ генома — это сложная и быстро развивающаяся область, которая включает изучение полного набора ДНК организма. С развитием передовых технологий секвенирования количество геномных данных, доступных для анализа, резко возросло в последние годы. Чтобы не отставать от этого темпа, исследователи обращаются к мощным инструментам программирования, таким как Python, для анализа, обработки и визуализации геномных данных. В этом блоге мы рассмотрим роль Python в анализе..
На этой неделе в TBP #4: GWAS и полигенное ожирение | Обучение подкреплению и противораковые соединения
Классификация глубокого обучения + SNP GWAS "Бумага" Полногеномные ассоциативные исследования являются важным инструментом для исследователей, поскольку они позволяют им выявлять варианты, связанные с интересующими фенотипами. Как правило, большое количество SNP исследуется индивидуально, значение p извлекается и корректируется, а последующий подробный анализ выполняется для придания смысла найденным SNP. Однако моделирование взаимодействия между SNP обычно не встроено в конвейеры...
Как я построил свой медицинский отчет из необработанных данных ДНК с помощью JavaScript
ВНИМАНИЕ: все, что я делал, ТОЛЬКО ЛЮБИТЕЛЬСКИЙ ЭКСПЕРИМЕНТ. У меня НЕТ образования или каких-либо глубоких знаний в области биологии. Я использовал свои школьные знания и обширную Википедию, чтобы выяснить, что там происходит. Полученные результаты НЕ МОГУТ рассматриваться как какие-либо проверенные медицинские исследования. Я настоятельно рекомендую вам платить за квалифицированные медицинские исследования в 23andMe, Ancestry или любой другой службе, которую вы используете для..
Параллельные и распределенные генетические алгоритмы
Эволюционные алгоритмы - мощное решение различных проблем оптимизации. Эволюционные алгоритмы помогают найти подходящее решение в случае, если найти его строгими методами настолько сложно, что можно сказать, что это невозможно. Один из самых популярных вариантов эволюционных алгоритмов - генетический алгоритм. Подробнее о генетических алгоритмах можно прочитать в статье Введение в генетические алгоритмы - включая пример кода . Иногда, если проблема сложная и люди тяжелые, может..
Эволюционные вычисления
Введение Эволюционные вычисления — это метод поиска и оптимизации, основанный на дарвиновском принципе естественного отбора. Он часто используется для поиска оптимальных или близких к оптимальным решений. В дарвиновском принципе естественного отбора есть ли виды, способные воспроизводить своих потомков, наследовать их черты и своих предков с некоторыми вариациями. Окружающая среда не могла поддерживать всех членов растущего населения. Члены с менее адаптивными шагами вымрут, а..
Введение в оптимизацию с помощью генетического алгоритма
Выбор оптимальных параметров для задач машинного обучения - непростая задача. Некоторые результаты могут быть плохими не потому, что данные зашумлены или используемый алгоритм обучения слабый, а из-за неправильного выбора значений параметров. В этой статье дается краткое введение в эволюционные алгоритмы (EAs) и описывается генетический алгоритм (GA), который является одним из простейших случайных советников. Введение Предположим, что у специалиста по данным есть набор данных..
Биологическая революция будет манипулировать самим процессом эволюции
Я очарован и шокирован тем, что происходит в области вычислительной биологии. Раньше биологи думали, что только 2% гена играют решающую роль, но по мере развития технологии анализа генов стало ясно, что остальные 98% не обязательно являются мусором (они действительно отвергли его как мусор). Например, они обнаружили, что некоторые гены отвечают за формирование нашего лица или устойчивость к различного рода заболеваниям. Другие гены даже контролируют время и объем производства вещества в..