Я экспериментирую с выдающейся библиотекой ggraph, чтобы изобразить некоторые действительно сложные для изображения взаимосвязи в научной работе. В частности, я хочу показать взаимодействия SNP-SNP в генетическом локусе. Было бы очень хорошо, если...

Я создаю образец сюжета сети эго, но я бы хотел, чтобы узлы были ближе друг к другу, в частности, узлы изменения ближе к узлу эго. Мой код: library(tidyverse) library(igraph) library(gridExtra) library(ggraph) library(tidygraph) library(ggplot2)...

У меня есть невзвешенный граф, и я хочу получить подграф, в котором есть только узлы и ребра, содержащие кратчайшие пути между n известными узлами. В этом случае 3 узла (имена 11, 29 и 13). Вопрос Как получить подграф кратчайшего пути между n...

У меня есть график с большим количеством соединений. Я предоставлю данные в конце. Я знаю, что есть невизуальные методы, которые я могу использовать для изучения, например, измерение коэффициентов кластеризации. Если я хочу изучить график...

Я пытаюсь построить сетевой график и показать только метки для geom_node_text, которые имеют показатель центральности выше определенного порога. Мой код ниже: rt_tbl %>% mutate(centrality = centrality_authority()) %>% ggraph(layout =...

какой формат данных необходим для создания макета кругового пакета ggraph? Кажется, это требует иерархии. Я пробовал обычно вершины и узлы, что, по-видимому, не работает. library(ggraph) library(igraph) edges=data.frame(from=c('a','b','c'),...

Я пытаюсь понять, как использовать макет широты / долготы в ggraph , но, похоже, не могу разобраться в синтаксисе. Рассмотрим это представление с некоторыми данными, измененными из набора данных iris : data <- structure(list(Sepal.Length =...

При рисовании сети было бы неплохо, если бы метки узлов также избегали границ сети. Например. в приведенном ниже примере можно было бы переместить все метки за пределы сети. Я пробовал несколько пакетов, но пока не нашел даже хитроумного способа...

Я использую ggraph для построения сетей, но у меня возникла проблема с сохранением в файл. Когда я сохраняю график в файл, он часто отсекает части сети. Я могу обойти это, увеличив ширину выходного графика. Но, похоже, растягивать сеть...

Я создал очень простой сетевой график с круговой компоновкой, используя ggraph. Угол меток узлов меняется по краю круга, чтобы их было легче читать. Однако метки усечены, и настройка полей, похоже, не имеет значения. Я поигрался с ggsave, egg и не...

У меня есть большой пространственно явный объект-граф (2746 узлов / 3205 ребер), показывающий пути переноса наносов в водосборном бассейне. С помощью команды all_simple_paths я извлек все пути, которые начинаются с определенных исходных узлов и...

я уже видел тему на тему с этой проблемой: library(ggraph) library(igraph) edges <- flare$edges vertices <- flare$vertices mygraph <- graph_from_data_frame(edges, vertices=vertices) ggraph(mygraph, layout = 'circlepack', weight =...

Я пытаюсь визуализировать сеть, настраивая некоторые стили. До сих пор я не справился с этой задачей. Требования: Только края с весом 2 должны иметь стрелку, указывающую в направлении ссылки. Ребро должно быть того же цвета, что и узел, от...

Я пытаюсь использовать изображения (например, флаги стран) в сети ggraph. Я хотел использовать geom_image от ggimage, однако считаю, что эту функцию нужно адаптировать для работы с ggraph, где мы не указываем координаты x и y....

Можно ли нарисовать стрелку в середине ребра с помощью ggraph::geom_edge_link() , и если да, то как это сделать? Вместо чего-то подобного со стрелками, нарисованными на концах краев: library(ggraph) library(tidygraph) library(dplyr)...