У меня есть филогенетическое дерево в формате .tre и сопутствующий набор данных. Точная форма дерева не имеет значения, это просто случайное филогенетическое дерево. В наборе данных есть два столбца: названия и цвета . При построении такого...

Я пытаюсь добавить тепловую карту к филогенетическому дереву с помощью функции ggtree gheatmap. Несмотря на отсутствие явных ошибок, появляющихся в строках, которые создают объект gheatmap, при попытке построить объект он возвращает ошибку:...

У меня проблемы с маркировкой отдельных подсказок в моем дереве с помощью ggtree. Я пытаюсь выделить и пометить узлы дерева с помощью geom_hilight и geom_cladelabel. Кажется, это нормально работает с узлами, имеющими более одной вершины дерева, но...

Я добавил некоторые черты к ветвям моей филограммы и увеличил ширину ветвей до их значения: library(ggtree) library(tidyverse) tree <- rtree(3, rooted = T) trait <- data.frame(node = 1:(length(tree$edge.length)+1), thing...

Можно ли добавить джойплот в виде панели к графику, который включает в себя ggtree, как показано в эти примеры ? Примеры радостных сюжетов находятся здесь . Я понимаю, что мог бы вручную поместить метки видов для графика радости в том же...

Уважаемое сообщество по переполнению стека, Я хотел бы попросить вас помочь с моей проблемой. Я использую пакет ggtree для построения филогенетических деревьев, и я хотел бы показать на этих графиках больше информации, как это обычно бывает в...

Я пытаюсь создать филогенетическое дерево с круговыми диаграммами на кончиках дерева, но я действительно застрял в том, как это сделать. Вот простой сфабрикованный пример library("treeio") library("ggtree") nwk <-...

В приведенном ниже примере используется ggtree, в котором я могу почистить подсказки в филогении и добавить метку аннотации («клада»). Шаги для запуска приложения - загрузить дерево - называется vert.tree проведите кистью (выделите) подсказки...