У меня есть список объектов hclust в результате незначительных изменений одной переменной (для вычисления матрицы расстояний) теперь я хотел бы сделать дерево консенсуса из этого списка. Есть ли для этого универсальный пакет? Я пробиваюсь...

Как я могу использовать hclust() в R, если набор данных, который я использую, имеет значения NA? Это функция, которую я настроил: data2 = apply(data,2, as.numeric) data2.hclust = hclust(data2, method='median') Когда я пытаюсь это сделать,...

Я пытаюсь сделать дендрограмму, используя большие данные. Я использую библиотеки stats , phyclust , distances <- phyclust.edist(Data[,],edist.model = .edist.model[3]) dataHClust <- hclust(distances, "ave") dhc <-...

Есть ли способ вычислить расстояние между двумя узлами, определяемое как высота их наименьшего общего предка , на дендрограмме hclust? Демонстрационный пример можно найти здесь: Аннотировать расстояние на узлах дендрограмм

Я создаю объект hclust вручную (т.е. создаю список с необходимыми слотами, затем меняю его класс на hclust ). Шаблон слияния, высоты бифуркаций, порядок листовых узлов и метки листовых узлов известны. Моя цель (и средство тестирования) -...

Я использую R для кластеризации матрицы, которую я назвал «данные ткани». У меня есть объект hclust, который был сгенерирован с использованием следующего кода: TissueDist<-dist(tissuedata, method="euclidean")...

Я попытался построить метод кластеризации как функцию следующими способами: mydata <- mtcars # Here I construct hclust as a function hclustfunc <- function(x) hclust(as.matrix(x),method="complete") # Define distance metric distfunc <-...

Я даю пример данных, предоставленных hclust справкой: mds2 <- -cmdscale(UScitiesD) hcity.D <- hclust(UScitiesD, "ward.D") plot(hcity.D, hang=-1) Когда вы рисуете это, метки сайтов расположены вертикально, что подходит для этого...

Я создаю пузырьковые диаграммы из кластеров данных NBA. Окончательная форма данных: Где Group.1 — индекс кластера, ad.SHOT_MADE_FLAG — процент попаданий с игры для кластера, coords.x1 и x2 — средние координаты x и y точек в этом кластере, а x...

Я попросил нескольких разных экспертов отсортировать 92 объекта на основе их сходства. На основе их ответов я построил матрицу несходства 92 х 92. в R я исследовал эту матрицу с помощью следующих команд: cluster1 <-...

У меня есть дерево hclust с почти 2000 образцами. Я обрезал его до соответствующего количества кластеров и хотел бы построить дендрограмму, но заканчивающуюся на высоте, на которой я разрезал кластеры, а не до каждого отдельного листа. Каждое...