Вопросы по теме 'pca'

Как извлечь компоненты после выполнения регрессии главных компонентов для дальнейшего анализа в пакете R caret
У меня был набор данных, содержащий 151 переменную, у которых была обнаружена высокая коллинеарность, поэтому я выполнил для него регрессию главных компонентов, выполнив следующие действия: ctrl <- trainControl(method = "repeatedcv", repeats =...
1691 просмотров
schedule 17.09.2021

Факторные нагрузки с использованием sklearn
Мне нужны корреляции между отдельными переменными и основными компонентами в Python. Я использую PCA в sklearn. Я не понимаю, как мне получить матрицу загрузки после того, как я разложил свои данные? Мой код здесь. iris = load_iris() data, y =...
27703 просмотров
schedule 16.11.2021

Спектральная кластеризация с матрицей подобия, построенной по коэффициенту жаккара
У меня есть категориальный набор данных, я выполняю на нем спектральную кластеризацию. Но я получаю не очень хорошие результаты. Я выбираю собственные векторы, соответствующие наибольшим собственным значениям, в качестве центроидов для k-средних....
616 просмотров

Доверительные интервалы нагрузок в главных компонентах в R
Я использую следующий код для анализа основных компонентов первых 4 столбцов набора данных радужной оболочки с использованием функции prcomp в R: > prcomp(iris[1:4]) Standard deviations: [1] 2.0562689 0.4926162 0.2796596 0.1543862 Rotation:...
3258 просмотров
schedule 29.10.2021

Изменение цвета точек и цвета рамки / эллипса вокруг точек
Я хочу начать с того, что я новичок в R и особенно на этом веб-сайте, поэтому, если мне необходимо что-то уточнить здесь, пожалуйста, дайте мне знать! Я еще не совсем все понимаю, поэтому, пожалуйста, не стесняйтесь «тупить» насколько это возможно....
24731 просмотров
schedule 26.09.2021

PCA prcomp: как получить график с ПК1 на ПК3
В моем скрипте для PCA (ниже) я всегда получаю график PC1 и PC2. mydata.pca <- prcomp(mydata.fixed, center = TRUE, scale. = TRUE) g <- ggbiplot(mydata.pca, obs.scale = 1, var.scale = 1, groups = mysamples, ellipse = FALSE,...
3606 просмотров
schedule 11.10.2021

Снижение размерности в векторе признаков HOG
Я обнаружил вектор функции HOG следующего изображения в MATLAB. Входное изображение Я использовал следующий код. I = imread('input.jpg'); I = rgb2gray(I); [features, visualization] = extractHOGFeatures(I,'CellSize',[16 16]);...
1404 просмотров

R предсказать одну строку
Я пытаюсь предсказать некоторые данные из PCA, используя перекрестную проверку с исключением по одному (LOO). prcomp идет хорошо, но когда я перехожу к predict , функция расстраивается ошибка: "новые данные" должны быть матрицей или...
1329 просмотров
schedule 10.09.2021

Как использовать собственные векторы, полученные с помощью PCA, для перепроецирования моих данных?
Я использую PCA для 100 изображений. Мои данные для обучения представляют собой матрицу 442368x100 double . 442368 - это характеристики, а 100 - количество изображений. Вот мой код для поиска собственного вектора. [ rows, cols] =...
952 просмотров

Как эффективно передать массив во фрейм данных?
Я запускаю PCA для столбцов фрейма данных DF1, и он возвращает массив основных компонентов. Я хотел бы создать фрейм данных DF2 с тем же индексом, что и DF1, и содержащий значение из массива основных компонентов. Из DF1= v1...
2025 просмотров
schedule 17.09.2021

Как рассчитать процентное соотношение видов для веганских объектов rda / cca?
Я пытаюсь воспроизвести столбец ("переменная" в FactoMineR::PCA , "виды" в vegan::rda ) процентное отношение к осям из пакета FactoMineR в vegan . Вклады закодированы в FactoMiner::PCA объектах: library(FactoMineR) library(vegan)...
783 просмотров
schedule 26.11.2021

Как выполнить итерацию PCA по скользящим окнам в R?
В настоящее время у меня есть набор ежемесячных данных временных рядов с 1993 года для 16 переменных. Я написал сценарий для запуска PCA в течение всего периода времени, но мне нужно выполнить расчеты для скользящих 12-месячных периодов времени...
41 просмотров
r pca
schedule 12.10.2021

Я хочу построить FactoMineR MFA с помеченными эллипсами и частичными векторами для групп
Я следую руководству по MFA, размещенному здесь: http://www.sthda.com/english/articles/31-principal-component-methods-in-r-practical-guide/116-mfa-multi-factor-analysis-in-r-essentials/ Я использовал эти библиотеки R в процессе:...
441 просмотров

Как выполнить анализ PCA для нескольких каналов из данных Landsat в Python?
Я хочу создать PCA из 5 полос Landsat для обнаружения изменений. Я знаю, как работать с arcgis, но могу найти решение в python (jupyter Notebook). У меня есть массив данных со всеми моими диапазонами varibale и lon и lat. Затем я создаю один массив...
166 просмотров
schedule 21.09.2021

Интерпретация двумерного графика PCA
Мне нужно понять, что передают диаграмма рассеяния, созданная двумя основными компонентами. Я работал над набором данных «бостонское жилье» из библиотеки «sklearn.datasets». Я стандартизировал предикторы и используемый PCA из библиотеки...
134 просмотров
schedule 18.11.2021

Есть ли формулы для расчета количества измерений или главных компонентов, соответствующих определенной величине дисперсии?
Я пытаюсь реализовать PCA в pytorch, учитывая ковариационную матрицу, ее собственные значения, собственные векторы и долю дисперсии, которая должна быть захвачена из матрицы данных, есть ли формулы для расчета количества измерений или основных...
32 просмотров

Уменьшение размерности - объяснение PCA
Я не думаю, что хорошо разбираюсь в PCA, может ли кто-нибудь помочь с моей путаницей ниже, пожалуйста? Возьмем, к примеру, набор данных радужной оболочки глаза, у меня есть 4 ковариаты, x1: длина чашелистника; x2: ширина чашелистника; x3: длина...
101 просмотров

Как построить график расстояния и результаты корреляционного двоичного графика SVD / PCA в R?
Я долго искал прямое объяснение биплотов расстояния и корреляции, а также объяснение того, как преобразовать стандартные выходные данные PCA для получения двух биплотов. Все объяснения переполнения стека 1 2 3 4 Я видел, что математические...
74 просмотров
schedule 09.11.2021

Как мне разделить гистограмму или график, показывающий количество основных основных компонентов?
Я выполнил анализ PCA с использованием функции prcomp отдельно от пакета FactoMineR на довольно значительном наборе данных размером 3000 x 500. Я попытался изобразить основные основные компоненты, которые покрывают до 100% совокупной доли...
351 просмотров
schedule 21.02.2022

Что означает выбор наибольших собственных значений и собственных векторов в ковариационной матрице при анализе данных?
Предположим, есть матрица B , размер которой равен 500*1000 double (здесь 500 представляет количество наблюдений, а 1000 представляет количество функций). sigma - ковариационная матрица B , а D - диагональная матрица, диагональные...
8914 просмотров