Вопросы по теме 'rscript'
Почему (или когда) Rscript (или меньше) лучше, чем R CMD BATCH?
Я автоматизирую сканирование с помощью R в cron , иногда использую R CMD BATCH , а иногда Rscript .
Чтобы решить, какой из них использовать, я в основном сосредотачиваюсь на том, хочу я файл .Rout или нет.
Но читая ответы на некоторые...
13267 просмотров
schedule
25.09.2021
Запуск сценария R из командной строки не приводит к выполнению кода
Я пробовал как Rscript, так и R CMD BATCH.
Например, если я запустил этот простой сценарий R:
test <- function(){
print("test")
}
используя
> R CMD BATCH test.R
Я получаю следующий файл test.Rout:
R version 3.0.1...
9776 просмотров
schedule
06.10.2021
Запись RDA в CSV на R
Я пытаюсь написать сценарий для загрузки RDA по имени файла и записи эквивалентного файла в формате CSV.
Он почти готов (с загрузкой и записью), однако выходной CSV содержит вектор строк, возвращаемых load (), а не фрейм данных, на который...
4896 просмотров
schedule
03.11.2021
Вызов Rscript из сценария оболочки Linux
Может ли кто-нибудь подсказать, как я могу заставить это работать ....
У меня есть сценарий R, который запускается за несколько минут и записывает несколько сотен строк вывода. Я хочу написать оболочку сценария оболочки вокруг этого сценария R,...
1008 просмотров
schedule
17.10.2021
Ошибка при использовании rscript
На моем Mac установлена версия R для Homebrew (OS X, El Capitan 10.11.5). Я успешно использую rscript около двух недель. Однако, когда я попытался запустить скрипт сегодня утром, используя rscript file.r , я получил следующую ошибку:...
1582 просмотров
schedule
21.11.2021
Предупреждающее сообщение Rscript
У меня есть следующий сценарий под названием Making_list_313_SNPs_from_csv.R. Вкратце, этот сценарий принимает файл .csv и выполняет некоторые быстрые преобразования для создания файла .txt.
.Csv имеет 8 столбцов, а интересующий меня столбец имеет...
352 просмотров
schedule
30.11.2021
показать ввод, как он выполняется с помощью Rscript
У меня есть сценарий Rscript, который я запускаю с помощью crontab, и для его завершения требуется много времени. Я добавляю его вывод в файл и засоряю код операторами print , чтобы отслеживать ход выполнения скрипта в фоновом режиме.
Это...
33 просмотров
schedule
01.12.2021
Сохранение истории для запуска скрипта Rscript через терминал / консоль
по работе я запускаю сценарии на виртуальных машинах в компьютерном кластере. Эти работы обычно большие и имеют большую производительность. Я бы хотел запустить сценарий через терминал. В конце скрипт создает свою копию, так что он содержит каждую...
74 просмотров
schedule
06.09.2021
Передача аргументов командной строки в R CMD BATCH
Я использовал R CMD BATCH my_script.R из терминала для выполнения R скрипта. Сейчас я нахожусь в той точке, где я хотел бы передать аргумент команде, но у меня есть некоторые проблемы с его работой. Если я сделаю R CMD BATCH my_script.R blabla...
131654 просмотров
schedule
24.02.2022
R отладка сценария Rscript с помощью браузера
Я ищу способ поставить точку останова во время выполнения сценария R, используя Rscript script.R или R --vanilla --silent -f script.R .
Я ожидаю, что R --vanilla --slave -e 'browser()' не просто выведет Called from: top level и выйдет, но...
241 просмотров
schedule
18.02.2022
Передача заголовка в качестве аргумента в Rscript (результат отличается от запуска кода в графическом интерфейсе)
Я работаю над фрагментом кода, который, среди прочих переменных, передает заголовок из bash-скрипта в R. Это может показаться глупым или глупым, но для моих конкретных нужд это именно то, что мне нужно. Итак, у меня есть bash-скрипт:
#!/bin/bash...
316 просмотров
schedule
05.04.2022
Как получить статус выхода сценария R, запущенного в сценарии оболочки
Предположим, я запускаю Rscript из этого сценария оболочки.
#!/bin/bash
RES=$(./abc.R 100)
r_status=echo $?
В abc.R есть код, который останавливает его выполнение.
#!/usr/bin/env Rscript
...
...
if(nrow(status) == 0)
{ stop("The list id...
2174 просмотров
schedule
05.04.2022
Оставление графиков, созданных RScript, на экране до взаимодействия с пользователем
У меня есть R-скрипт, который запрашивает базу данных, выполняет некоторый анализ, строит несколько диаграмм на основе текущей системной даты.
Я хочу, чтобы этот скрипт запускался ежедневно при загрузке, я думал, что смогу сделать это довольно...
2792 просмотров
schedule
25.04.2022
Как обеспечить закрытие параллельных процессов Rscript.exe с моим сеансом R?
Я использую пакет parallel для одновременного запуска функции сервера несколько раз. Функция сервера зацикливается до тех пор, пока сеанс не будет остановлен пользователем вручную.
Это выглядит как:
library(parallel)
cluster <-...
713 просмотров
schedule
11.07.2022
Переопределение определенных флагов компилятора при установке пакетов R
У меня есть сценарий R, который пытается установить много пакетов (все пропущены, кроме одного):
install.packages("zoo")
Тогда я бегу
Rscript my_r.r
Затем я заметил, что он попытается скомпилировать код на C:
gcc -m64...
71 просмотров
schedule
22.07.2022
Запуск Rscript в командной строке и загрузка пакетов
У меня есть файл foo.R, который содержит
library("ggplot2")
cat("Its working")
Я пытаюсь запустить foo.r через командную строку, используя команду Rscript command Rscript --default-packages=ggplot2 foo.R , и это дает мне следующую ошибку:...
6308 просмотров
schedule
12.08.2022
Как реализовать функцию renderImage
Я не могу загрузить изображение через подкаталог на блестящей веб-странице.
Я создал папку подкаталога с именем "www" и поместил изображение.
Я также пытался использовать URL.
До сих пор не работает
imageOutput("d", width = 300, height...
114 просмотров
schedule
16.08.2022
Не удается выполнить RScript из php
Новое здесь, также новое для кодирования с php. В настоящее время я пытаюсь выполнить RScript из php, используя функцию exec(). Когда я запускаю php-код на локальном хосте, он открывает программу RStudio, но не выполняет код в сценарии. (Это...
188 просмотров
schedule
18.08.2022
Rscript не распознает функцию setGeneric
Я пытаюсь преобразовать сценарий R во что-то, что клиент может запускать в пакетном режиме. В моем коде используются общие функции, и один фрагмент, который находится ближе к началу, выглядит следующим образом:
setGeneric("testInput",...
461 просмотров
schedule
15.09.2022
пользовательский ввод в R (командная строка Rscript и Widows)
Я пытаюсь выяснить, как я могу запустить r-скрипт, используя Rscript в командной строке Windows и запрашивая ввод пользователя.
До сих пор я нашел ответы о том, как запрашивать ввод данных пользователем в интерактивной оболочке R. Любые попытки...
5993 просмотров
schedule
22.09.2022
