Вопросы по теме 'rstan'

Rstan на Rstudio MCMC имеет слишком высокое время работы (ограниченное использование доступного ЦП и ОЗУ)
Я новичок в мире Рстана, но мне он очень нужен для моей диссертации. На самом деле я использую сценарий и аналогичный набор данных от парня из Нью-Йоркского университета, который сообщает, что примерное время для аналогичного DS составляет около 18...
534 просмотров
rstudio r rstan mcmc stan
schedule 05.09.2021
Многомерный нормальный наклон в стандартном выражении
Я пытаюсь оценить байесовскую иерархическую модель в Rstan и хотел бы включить в свою модель многомерное косое нормальное распределение. Это не дистрибутив, который уже определен в Stan, но в документации, кажется, предполагается, что его можно...
536 просмотров
rstan distribution stan
schedule 22.11.2021
Стандартный код работает в Windows, но не в Linux
У меня есть следующий код Stan, отлично работающий при использовании с rstan в Windows. Однако при работе в кластере с Linux (CentOS 6) он выдает очень длинную ошибку, которая включает ~ 500 строк, я думаю, кода Rcpp, а последний фрагмент выглядит...
104 просмотров
linux rstan stan
schedule 15.09.2021
Оценка назначения кластера с помощью Stan
Я пытаюсь подогнать модель конечной гауссовой смеси с неизвестным средним значением и ковариациями, используя Stan. Я знаю, что, поскольку HMC не может быть применен к выборке из дискретных распределений, метод маргинализации обычно используется для...
355 просмотров
rstan mcmc stan
schedule 17.10.2021
Апостериорные прогнозы стандартной модели за пределами возможного диапазона данных
Я получаю массу удовольствия прямо сейчас, изучая основы моделирования в Стэне. Прямо сейчас я борюсь со своей моделью смешанного факторного экспериментального дизайна между и внутри субъектов. Существуют разные группы субъектов. Каждый субъект...
468 просмотров
r rstan stan
schedule 19.03.2022
Извлечь и добавить к данным значения функции плотности вероятности на основе стандартной линейной модели.
Учитывая образцы данных sampleDT и модели lm.fit и brm.fit ниже, я хотел бы: оценить, извлечь и добавить к кадру данных значения функции плотности для условного нормального распределения, оцененного на наблюдаемом уровне переменной...
80 просмотров
r rstan bayesian probability-density stan
schedule 07.06.2022
не могу установить rstan, потому что зависит от самого себя
Я пытаюсь установить Rstan на сервер Debian для Rstudio и, похоже, это тупик. Проблема в следующем: Я устанавливаю пакет, который зависит от rstan. Поэтому я пытаюсь установить rstan перед установить.пакет("рстан") Ошибка: rstan...
140 просмотров
r rstan shiny
schedule 27.08.2022
стандартное программирование для модели ETAS
Я новичок в STAN. Я работаю над временной моделью ETAS, моделью, используемой для моделирования землетрясений. Интенсивность землетрясения во время t [i] моделируется как: h(t[i]|p,c,mu)=mu+sum((p-1)*(c^(p-1))*(1/((t[i]-t[1:(i-1)]+c)^(p-1))));...
481 просмотров
rstan bayesian stan
schedule 27.12.2022
Установить приоры для нескольких предикторов в rstanarm?
Я немного запутался в том, как установить априорные значения для нескольких предикторов для следующей модели: require(rstanarm) wi_prior <- normal(0, sd(train$attendance)) SEED <- 101 fmla <- attendance ~ (1 + W + W1 + W2 + W3 +...
528 просмотров
r rstan
schedule 27.10.2022
Как рассчитать разности между коэффициентами (категориальными переменными) процедуры glm в Rstan
У меня вопрос о том, как вычислить различия между коэффициентами (категориальными переменными) glm в Rstan. В качестве примера я использовал набор данных радужки в R, чтобы судить, могу ли я вычислить апостериорное распределение разностей...
242 просмотров
r rstan comparison bayesian glm
schedule 16.05.2023
Эффективная выборка набора мульти-нормальных переменных с переменной сигма (ковариационной) матрицей
Я новичок в Стэне, так что надеюсь, что вы укажете мне правильное направление. Я буду работать над своей ситуацией, чтобы убедиться, что мы на одной волне ... Если бы у меня была коллекция одномерных нормалей, в документации мне сказали бы, что:...
1462 просмотров
rstan stan pystan
schedule 22.10.2022
Что означает двоеточие в Стэне?
Я новичок в программировании на Стэне и пытаюсь проработать код, который нашел в Интернете: https://modernstatisticalworkflow.blogspot.com/2017/11/bayesian-instrumental-variables-with.html data { int N; int PX; // dimension of exogenous...
340 просмотров
rstan stan
schedule 01.09.2023
Построение апостериорных оценок параметров из нескольких моделей с байес-графиком
Я использую отличную библиотеку построения графиков bayesplot для визуализации интервалов апостериорной вероятности из моделей, которые я оцениваю с помощью rstanarm . Я хочу графически сравнить розыгрыши из разных моделей, получая апостериорные...
328 просмотров
r rstan ggplot2 rstanarm
schedule 26.03.2023
Будет ли Rstan быстрее подгонять модели с данными, хранящимися в виде матрицы или data.frame?
Я подгоняю серию многоуровневых логистических регрессий , используя rstan с помощью функции map2stan в библиотеке rethinking . Все работает нормально, модели все подходят и сходятся. Однако наборы данных, с которыми я работаю, очень велики,...
75 просмотров
r rstan dataframe matrix logistic-regression
schedule 08.12.2022
ZIP - Скрытая марковская модель r Stan
Я пытаюсь настроить марковскую модель с нулевым завышением Пуассона, скрытой от Стэна. Для Poisson-HMM на прошлом форуме эта настройка была показана. см. ссылку . В то время как для настройки ZIP с классическая теория хорошо документирована...
428 просмотров
r rstan
schedule 31.10.2022
Извлечение данных в преобразованном блоке данных в файле Stan
Я хочу извлечь z в преобразованном блоке данных из объекта stanfit f . Является ли это возможным? library(rstan) m <- stan_model(model_code = ' data{real x;} transformed...
431 просмотров
r rstan
schedule 23.03.2023
Как сохранить множество brms в виде отдельных объектов R или файла Rds/Rda?
Я пытаюсь подогнать байесовскую модель, используя brms::brm() , заменяя априор одного параметра в модели один за другим на purrr::map2() (у меня есть 63 априора для этого параметра). Я могу «теоретически» сохранить каждую подогнанную модель как...
280 просмотров
r rstan out-of-memory purrr
schedule 03.03.2023
Как указать информативный априор только для одного конкретного предиктора в rstanarm
В настоящее время я пытаюсь подогнать байесовскую многоуровневую модель, используя rstanarm. Я ожидаю — и в литературе есть доказательства — что коэффициент моего основного предиктора находится между 0,15 и 0,65. Поэтому я хотел бы установить...
35 просмотров
r rstan rstanarm
schedule 28.04.2023