Вопросы по теме 'survival'
Набор данных о выживании, разбитый по годам, начиная с 1 января
У меня есть следующий набор данных о выживании, который я хотел бы разделить на 1 января каждого года. Например, для персонажа 1220 я бы сделал разделение на 1912-01-01, 1913-01-01, 1914-01-01, 1915-01-01. Я пробовал использовать survSplit , но они...
58 просмотров
schedule
06.11.2021
Представьте, что вы пережили ядерную войну и вам нужно ПЕРЕСТРОИТЬ программу golang, чтобы любой ценой использовать локальные модули
Акцент на вопрос находится в конце заголовка. Пытался из моего воображения.
Представьте, что вы пережили ядерную войну, и вы всего лишь команда выживших в своем автоматизированном хранилище, операционная логика которого иногда записывается на...
235 просмотров
schedule
29.10.2021
Невероятно широкие доверительные интервалы, полученные с помощью функции Surfit () для данных с интервальной цензурой
У меня есть данные, полученные в результате периодических интервью, в которых человека спрашивают, испытывает ли он определенный симптом. Последний раз, когда каждый человек не имел этот конкретный симптом, обозначается как tstart . Если...
125 просмотров
schedule
26.11.2021
Почему два разных результата от coxph в R с одинаковым временем остановки и начала?
Я наткнулся на препятствие в своем анализе выживаемости; Я думаю, это связано с типом цензуры. Вот первые 30 строк моих данных о выживании. tstart - это когда пациент поступил и начал получать вмешательство, tstop - либо смерть (статус = 1), либо...
131 просмотров
schedule
22.09.2021
Как создать ковариацию, зависящую от времени, для использования в модели `coxph` в пакете выживания в r?
У меня есть такой набор данных:
id status time event
<chr> <dbl> <dbl> <time>
1 22016890 1 459 425 days
2 22042190 1 83 NA days
3 18108887 1 373 NA days
4 17706799 1 33...
106 просмотров
schedule
16.03.2022
Синтаксис для анализа выживаемости с поздним входом
Я пытаюсь приспособить модель выживания с усеченными слева данными с помощью пакета survival , однако я не уверен в правильном синтаксисе.
Допустим, мы измеряем влияние возраста при приеме на работу ( age ) и типа работы ( parttime ) на...
475 просмотров
schedule
13.04.2022
Запись времени выживания Xgboost cox
Как в новой реализации модели выживания cox ph в xgboost 0.81 указать время начала и окончания события?
Спасибо
Эквивалентная функция R будет, например, такой:
cph_mod = coxph(Surv(Start, Stop, Status) ~ Age + Sex + SBP, data=data)
4581 просмотров
schedule
22.04.2022
Изменить форму данных на основе разных столбцов
Мне нужно изменить форму моих данных, чтобы привести их в надлежащий формат для Анализа выживания.
Мой текущий набор данных выглядит так:
Product_Number Date Status
A 2018-01-01 0
A...
49 просмотров
schedule
28.06.2022
Получение слишком длинного логического индекса ошибки (индекса)
Я пытаюсь запустить следующий код, но получил эту ошибку Ошибка в unclass(x)[i, , drop = FALSE]: (индекс) слишком длинный логический индекс
library ( survival )
library(KMsurv)
data("tongue")
tongue
Weibull.1<-survreg(Surv(times,censor)~1,...
160 просмотров
schedule
22.07.2022
В R: survminer::ggsurvplot с fun = cloglog возвращает предупреждающее сообщение и пустой график
Пожалуйста, обратите внимание на следующее:
С помощью пакета survminer мы можем рисовать график «лог-лог» для объектов выживания, созданных с помощью пакета survival . Это было представлено некоторое время назад разработчиком пакета @kassambara...
1002 просмотров
schedule
16.08.2022
почему результаты функций clogit и bife (оба в R) различаются?
Мне нравится вычислять панельную регрессию логистического фиксированного эффекта (условная максимальная вероятность) в R и получать прогнозируемые значения и/или средние предельные эффекты.
Нашел две функции: bife и clogit из пакетов выживания...
280 просмотров
schedule
25.08.2022
Создайте бумажный график вероятности Вейбулла в R
Я пытаюсь создать базовый график для графика вероятности Вейбулла. Я изучал пакет survival в R, но еще не нашел именно тот инструмент, который мне нужен. До сих пор мне удавалось вручную воссоздать нужный мне сюжет (что ужасно — тонны жесткого...
1293 просмотров
schedule
31.08.2022
Наборы данных процесса подсчета для моделей непропорциональной опасности (Кокса) с переменными взаимодействия
Я пытаюсь запустить модель непропорциональной регрессии Кокса с переменной взаимодействия со временем, как описано в главе 15 (раздел 15.3) Прикладного анализа продольных данных Зингера и Виллетта. Однако я не могу получить ответы, согласующиеся с...
261 просмотров
schedule
28.12.2022
Создание функции, передающей свои аргументы функции Surv (или любой другой)
Пожалуйста, обратите внимание на следующее:
Для создания кривой выживания можно использовать функцию survfit пакета survival .
Моя цель — написать функцию, которая (среди прочего) создает такую кривую, но эта функция должна работать с...
560 просмотров
schedule
20.06.2023
как исправить «Ошибка: длины переменных различаются (найдено для ‘input$s’)» в R Shiny
Я пытаюсь сделать простое блестящее приложение для создания кривых выживания Каплана-Мейера, которые стратифицируются в зависимости от выбора, который делает пользователь. Когда я статически кодирую расчет KM (с именем столбца thorTr), он работает,...
1345 просмотров
schedule
15.03.2023
Есть ли способ, чтобы уже определенный аргумент мог отображаться как отсутствующий при использовании функции optim() в R?
Я пытаюсь получить оценки максимального правдоподобия логарифмического правдоподобия распределения Гамбеля для анализа выживания (я говорю это, чтобы вас не смущала функция логарифмического правдоподобия, я думаю, что это правильно). Чтобы сделать...
69 просмотров
schedule
16.08.2023
Настройка типа линии в скорректированных кривых выживания ggadjustedcurves (survminer, ggplot2)
Я пытаюсь построить скорректированную кривую выживания, но борюсь с изменением типов линий по группам. Я могу настроить другие аспекты графика, используя типичный язык ggplot2, но я столкнулся с проблемой изменения типа линии.
Пример:...
484 просмотров
schedule
26.01.2023
Почему выживание :: tmerge внезапно выдает ошибку: ни аргумент tstop, ни аргумент начального события не найдены?
Я пытаюсь запустить следующий код, включая survival :: tmerge () , чтобы провести анализ выживаемости с изменяющимися во времени ковариатами, но всегда получаю сообщение об ошибке
Ошибка в tmerge (df.merge% ›% select (CODE98, id), df.long, id =...
53 просмотров
schedule
25.02.2023
Моделирование ускоренного времени отказа: построение вероятностей выживания с помощью CI-s (приведен пример)
Поскольку предположение о пропорциональных рисках нарушается моими реальными данными, я использую модель AFT, пытаясь рассчитать скорректированные вероятности выживания для интересующих групп исследования. Пример ниже относится к почкам . data, и я...
65 просмотров
schedule
16.02.2023
Функция выживания - интерполяция в R
Я построил функцию выживания, такую как:
[