Публикации по теме 'survival-analysis'
Спасибо за этот интересный пост.
Спасибо за этот интересный пост.
Создание будущего прогнозов ран с использованием машинного обучения
Введение
Swift Medical ежедневно помогает клиницистам лечить десятки тысяч острых и хронических ран. В отличие от острых ран, хронические раны не заживают своевременно и затрагивают миллионы людей во всем мире. Эти раны приводят к снижению качества жизни из-за боли, страданий и других сопутствующих осложнений, таких как инфекция и ампутация. Кроме того, эти раны очень дороги в лечении и, следовательно, ежегодно обходятся системам здравоохранения в огромные суммы денег. Согласно оценке..
Использование анализа выживания для моделирования времени до значения по умолчанию
В связи с недавним финансовым кризисом, поразившим США и Европу, моделирование кредитных рисков стало как никогда важным. Внедрение руководящих принципов соответствия, таких как Базельское соглашение и соглашение о платежеспособности, оказало огромное влияние на стратегии финансовых учреждений. В основном в связи с заявлением о соглашении Базель II, которое позволяет крупным банкам оценивать риск на основе своих собственных моделей, чтобы определить минимальный объем капитала, который им..
Вопросы по теме 'survival-analysis'
Данные, зависящие от времени в функции coxph пакета выживания
При рассмотрении данных, зависящих от времени в анализе выживаемости, у вас есть несколько моментов времени начала и окончания для отдельного субъекта с измерениями ковариат в качестве каждого времени начала и окончания. Как функция coxph...
1292 просмотров
schedule
23.11.2021
Как мне создать объект выживания в R?
Вопрос, который я публикую здесь, тесно связан с другим вопросом, который я опубликовал два дня назад, об анализе старения gompertz.
Я пытаюсь построить объект выживания, см. Surv, в R. Надеюсь, он будет использован для выполнения анализа...
1899 просмотров
schedule
30.10.2021
Вычислить AIC в анализе выживаемости (Survfit / Coxph)
Я хочу вычислить значение AIC для моих объектов анализа выживаемости (suvfit / coxph). Когда я пытаюсь это сделать, он говорит:
> AIC(cox)
Error in UseMethod("logLik") :
no applicable method for 'logLik' applied to an object of class...
6763 просмотров
schedule
09.11.2021
Есть ли способ получить частичную вероятность модели Кокса PH с новыми данными и фиксированными коэффициентами?
Я выполняю перекрестную проверку модели пропорциональных рисков конкурирующих рисков. С помощью mstate pacakge я подготовил свои данные и подгоняю их с survival::coxph . Я получаю подобранный объект модели Кокса для моих обучающих данных, но я...
2636 просмотров
schedule
06.11.2021
Создание временных переменных для модели условного набора рисков (регрессия Кокса)
Я готовлю набор данных для соответствия модели набора условных рисков с помощью стратифицированной регрессии Кокса. И мне было интересно, есть ли способ создать нужные мне переменные без выполнения длительных циклов.
По сути, мой фрейм данных...
251 просмотров
schedule
24.11.2021
Постройте только две кривые (не все) в выводе сурфита в R
У меня есть набор данных о выживаемости с ковариатом (подтип) в 5 группах. Мне удалось построить 5 групп, используя:
km.type <- survfit(SurvObj ~ SubType, data = data, conf.type = "log-log")
plot(km.type, mark.time=FALSE)
Я хотел бы...
941 просмотров
schedule
05.11.2021
Составление таблиц дожития для использования при анализе выживаемости
Я пытаюсь использовать пакет relsurv в R, чтобы сравнить выживаемость когорты с национальными таблицами дожития. В приведенном ниже коде показана моя проблема с использованием примера из relsurv, но с изменением данных таблицы жизни. Я только что...
757 просмотров
schedule
25.11.2021
Байесовский анализ выживаемости
Я просматриваю функцию R indeptCoxph в пакете spBayesSurv, который соответствует байесовской модели Кокса. Меня смущают некоторые входные параметры этой функции. (У меня также были некоторые вопросы о коде R, который я разместил здесь отдельно:...
528 просмотров
schedule
04.10.2021
Включить Weibull Fit в ggsurvplot
Я хотел бы подогнать кривую Вейбулла к некоторым данным событий, а затем включить подобранную кривую Вейбулла в график выживаемости, построенный с помощью Survminer :: ggsurvplot. Есть идеи как? Вот пример для работы:
Функция для моделирования...
1058 просмотров
schedule
17.11.2021
Оценки параметров и дисперсия для стратифицированных переменных в регрессии Кокса (пакет страта / выживаемость)
Я выполнил регрессию Кокса с использованием пакета survival для расчета коэффициента риска смертности от воздействия A. Я обнаружил, что переменная age нарушает допущение о пропорциональном риске (с cox.zph ) и использовал strata(age) для...
563 просмотров
schedule
18.11.2021
Оценка выживаемости Каплана-Мейера для нескольких переменных в R
Я пытаюсь найти оценки Каплана-Мейера для нескольких переменных.
У меня есть data.set, который выглядит так:
fw_year steroid_dos status current_dos
1 6.3271732 0.0 0 7.5-14.9 mg
24 4.5530457 0.0 0...
634 просмотров
schedule
02.11.2021
Как работать с необратимой матрицей в анализе выживаемости
Я новичок в анализе выживаемости. Пробовал использовать CoxPHFitter , но наткнулся на эту ошибку. numpy.linalg.linalg.LinAlgError: Matrix is singular.
Пройдя через эту ошибку, я узнал, что в одном из моих столбцов есть необратимая матрица....
853 просмотров
schedule
13.10.2021
Невероятно широкие доверительные интервалы, полученные с помощью функции Surfit () для данных с интервальной цензурой
У меня есть данные, полученные в результате периодических интервью, в которых человека спрашивают, испытывает ли он определенный симптом. Последний раз, когда каждый человек не имел этот конкретный симптом, обозначается как tstart . Если...
125 просмотров
schedule
26.11.2021
Почему два разных результата от coxph в R с одинаковым временем остановки и начала?
Я наткнулся на препятствие в своем анализе выживаемости; Я думаю, это связано с типом цензуры. Вот первые 30 строк моих данных о выживании. tstart - это когда пациент поступил и начал получать вмешательство, tstop - либо смерть (статус = 1), либо...
131 просмотров
schedule
22.09.2021
Несколько входов для coxph
Есть ли способ запустить coxph для нескольких входов. Здесь я использовал ввод hsa_let_7b_5p .
coxph(Surv(Time, Status)~ hsa_let_7b_5p, data=as.data.frame(test))
Call:
coxph(formula = Surv(Time, Status) ~ hsa_let_7b_5p, data =...
213 просмотров
schedule
02.03.2022
Модель Кокса с конкурирующим риском для выживания
Я использую пакет survival для анализа конкурирующих рисков и хотел бы использовать прогноз для моделирования.
Я планирую выбрать однородный случайный x из [0, 1], найти время завершения из кривой выживания, которая пересекается с x; а затем...
298 просмотров
schedule
02.03.2022
Как создать ковариацию, зависящую от времени, для использования в модели `coxph` в пакете выживания в r?
У меня есть такой набор данных:
id status time event
<chr> <dbl> <dbl> <time>
1 22016890 1 459 425 days
2 22042190 1 83 NA days
3 18108887 1 373 NA days
4 17706799 1 33...
106 просмотров
schedule
16.03.2022
Распределение Гаусса для цензурированной регрессии с cenreg
Я пытаюсь использовать функцию cenreg в пакете NADA в R для запуска цензурированной регрессии с распределением Гаусса. Функция работает с логнормальным распределением, но возвращает ошибку, когда я пытаюсь использовать распределение Гаусса....
140 просмотров
schedule
28.03.2022
R- Формула выживаемости при ошибке, пакет выживаемости
Я изучаю основы пакета выживания в R с помощью этого руководства
Я выполнил указанные действия и получил сообщение об ошибке: Данные находятся в пакете:
aml<-aml
И на странице 2 учебника:...
3210 просмотров
schedule
04.04.2022
Выживание не распознает правильно цензурированные данные
Я пытаюсь провести анализ выживаемости в R с помощью пакета survival . У меня есть только данные, подвергнутые цензуре справа (время до события, затем событие "1" или цензура "0"). Я создал объект выживания с помощью функции Surv . Однако...
12837 просмотров
schedule
05.04.2022
