Вопросы по теме 'lapply'
Использование многоядерности в R для анализа данных GWAS
Я использую R для анализа данных исследования ассоциации по всему геному. У меня есть около 500 000 потенциальных переменных-предикторов (однонуклеотидные полиморфизмы или SNP), и я хочу проверить связь между каждой из них и постоянным результатом (в...
1320 просмотров
schedule
23.09.2021
Сравните предыдущий элемент списка, используя семейство функций Apply R, избавьтесь от циклов for
Я всегда стараюсь свести к минимуму использование циклов for в R. Есть ли способ сравнить текущий элемент с предыдущим элементом в списке без цикла for? Вот упрощенная версия проблемы, над которой я работаю.
Я хочу отметить столбец...
606 просмотров
schedule
15.09.2021
вычислить среднее значение (или другую функцию) на столбец для подмножеств матрицы на основе другой матрицы
Я работаю в R с классификатором, который выводит матрицу реальных значений с одним столбцом для каждого класса, который я классифицирую. Затем я применяю функцию к выходной матрице и моей матрице меток класса (один столбец на класс), чтобы вычислить...
280 просмотров
schedule
20.09.2021
Как объединить элементы фреймов данных разных размеров, содержащихся в списке [R]?
У меня есть список, состоящий из 5 data.frames разных размеров, каждая data.frame имеет две переменные, Group.1 и x , я хотел бы объединить эти data.frames с помощью Group.1 переменных. Конечно, я ожидаю, что будет сгенерировано NA...
94 просмотров
schedule
21.11.2021
создать функцию, дающую тот же результат, что и lapply в R
Я пытаюсь проанализировать эффективность функции lapply в R, но я не нашел исходного кода разработки lapply в папке «base», поэтому я написал простой код сам.
new_lapply<-function(data,f_name){
list<-list()
for (i in length(data)){...
80 просмотров
schedule
30.09.2021
lapply () очищает список шаг за шагом во время обработки
Прежде всего, извините за плохое название. Я до сих пор так запутался в этом поведении, что не мог его описать; однако мне удалось воспроизвести его и разбить на (тупой) пример.
Пожалуйста, не могли бы вы быть так любезны и объяснить, почему...
94 просмотров
schedule
09.11.2021
Найдите ближайшее значение с условием
У меня есть функция, которая находит ближайшие значения для каждой строки в матрице. Затем он сообщает список с индексом ближайших строк. Однако я хочу, чтобы он исключил значения, если они равны +1 в первом и +1 во втором столбце вдали от...
935 просмотров
schedule
09.10.2021
lapply и функция сохранения в R
Я создал список объектов в своей рабочей среде
data <- c("variable1", "variable2", "variable3")
Я хотел бы сохранить файлы в разных каталогах с именем переменной в качестве каталога ... поэтому я сделал это, чтобы дать мне список имен...
1622 просмотров
schedule
26.09.2021
rbindlist data.tables разных размеров
Я выполняю функцию несколько раз с разными выходами, как показано на примере.
require(data.table)
myfunction<-function(x){
DT1<-data.table(a=c(1,2,3),b=c("a","b","c"))
DT2<-data.table(d=c(4,5,6), e=c("d","e","f"))
return(list(DT1=DT1,...
231 просмотров
schedule
06.11.2021
R имена столбцов gsub во всех фреймах данных в списке
У меня есть список фреймов данных с именами столбцов, которые я хочу заменить некоторыми строками, но не могу сделать это правильно.
list:
[1]
cpg value.TCGA.06.5415.01A value.TCGA.02.0003.01A value.TCGA.16.1062.01A
cg02726808 0.934641544...
935 просмотров
schedule
04.11.2021
R: различные ошибки от использования apply ()
Я пытался отладить это в течение последних 2 дней, применяя все возможные исправления, которые я нашел здесь, на Stack Overflow, но у меня все еще возникают различные ошибки, и я не знаю, что я могу сделать.
dat - это фрейм данных с 3051 строкой...
93 просмотров
schedule
28.10.2021
Почему вычисление для каждой строки выполняется быстрее, чем проверка того, было ли выполнено вычисление?
Я работал над фреймом данных с 200 000+ строками и множеством столбцов. Возьмем пример фиктивной версии, такой как df:
set.seed(1)
"timeslot" = c(as.integer(abs(runif(10000,min=1,max=1000))))
"ID" =...
142 просмотров
schedule
30.09.2021
использование функции apply с ggplot2 для создания гистограмм для более чем одной переменной в data.frame
Есть ли способ использовать функцию применения в R для создания штриховых диаграмм с ggplot2 ?
Скажем, у нас есть фрейм данных, содержащий только факторные переменные, одна из которых является логической. В моем случае у меня есть датафрейм с +40...
2117 просмотров
schedule
27.09.2021
Как использовать функцию подстроки с применением в R?
Набор данных содержит информацию о супергероях. Этот код удаляет раздражающую скобку из строки name:
# package loading
library(fivethirtyeight)
# data opening
data(package ="fivethirtyeight")
data(comic_characters)
for (i in...
1127 просмотров
schedule
27.10.2021
извлечение фрейма данных из списка по множеству объектов
У меня более 1000 объектов ( z ) в R, каждый из которых содержит три фрейма данных ( df1 , df2 , df3 ) с разными структурами.
z1$df1 … z1000$df1
z1$df2 … z1000$df2
z1$df3 … z1000$df3
Я создал список этих...
2401 просмотров
schedule
04.11.2021
Na.action = исключить ошибку в lapply
У меня есть фреймворк с 507 столбцами. Первый столбец - это дата наблюдения. Столбцы со 2 по 504 - мои зависимые переменные. Столбцы 505, 506 и 507 являются независимыми переменными. Я написал функцию для отдельной регрессии для каждой зависимой...
155 просмотров
schedule
05.12.2021
Используйте lapply для работы с содержимым списков
Я должен разделить для каждого фрейма данных содержимое столбца mod , когда присутствует | . Найдите мой код ниже. Я хочу использовать lapply, но это не работает. Другие предложения все еще в порядке
prot<-rep('AAAA', times=5)...
37 просмотров
schedule
30.11.2021
Winsorizing по всем столбцам в кадре данных (R) с помощью `lapply`
Я пытаюсь применить функцию Winsorize() , используя lapply из пакета library(DescTools) . В настоящее время у меня есть;
data$col1 <- Winsorize(data$col1)
Что по существу заменяет крайние значения значением, основанным на квантилях,...
5278 просмотров
schedule
06.09.2021
Используйте lapply для объединения элементов списка
Вопрос следует ниже. Сначала рабочий пример:
library(stringr)
library(rebus)
phone_numbers_mat <- structure(c("555-555-0191", NA, "555) 555 0191", "555.555.0191",
"555", NA, "555", "555", "555", NA, "555", "555", "0191", NA,
"0191",...
336 просмотров
schedule
30.10.2021
почему purrr :: map2 такой медленный по сравнению с базовым mapply?
Рассмотрим этот простой тест
list1 <- as.list(rep(1, 50))
list2 <- as.list(rep(1, 50))
microbenchmark::microbenchmark(
+ map2(list1, list2, sum))
Unit: microseconds
expr min lq mean median uq...
751 просмотров
schedule
27.09.2021
